Chaque tour se déroule en un seul match. En cas d'égalité, une prolongation de 2 périodes de 15 minutes est disputée. Si l'égalité persiste, une séance de tirs au but départage les 2 équipes.
Résultats
Tours préliminaires
Premier tour
19 équipes de Ligue 2 (l'AS Nancy-Lorraine, dix-huitième de la saison de Ligue 1 précédente est exempté) et 3 équipes de National (Gazelec Ajaccio relégué + Amiens et Boulogne ayant le statut pro) débutent cette Coupe de la Ligue.
Ce tour est prévu le mardi 6 et le mercredi 7 août 2013. Le tirage au sort a lieu le mercredi 17 juillet à 12h00 au siège de la Ligue de football professionnel[1].
Les 10 rencontres sont prévues les mardi 29 et mercredi 30 octobre 2013. Les six vainqueurs du deuxième tour sont rejoints par les 14 équipes de Ligue 1 qui ne participent à aucune Coupe d'Europe.
Les huitièmes de finale se déroulent les mardi 17 et mercredi 18 décembre 2013. Ce tour signifie l'arrivée des six clubs « européens ». Les quatre premiers de la saison de Ligue 1 2012-2013 (le Paris Saint-Germain, l'Olympique de Marseille, l’Olympique lyonnais et l'OGC Nice) ont le statut de tête de série : ils ne peuvent s'affronter.