Le col de Banyuls était anciennement appelé col d'Espils[4]. Il a alors donné son nom aux deux peuplements situés sur chacun de ses versants : Les Abeilles et Espolla. Le nom d'Espils lui-même vient sans doute de specula[5], du nom latin pour une tour de guet, turris speculatoria[6].
Ce col est un point de passage historique, probablement utilisé depuis l'Antiquité. C'est un des passages possibles de la voie héracléenne et probablement un des passages secondaires de la voie Domitienne[7].
Les troupes espagnoles voulant récupérer la région du Roussillon, tentent une invasion dirigée par le général Ricardos en 1793. Mais durant la bataille du col de Banyuls, ceux-ci se heurtent à la résistance des habitants.
En janvier 2021, il est fermé afin de lutter contre le trafic, le terrorisme et l’immigration illégale[10]. Cette fermeture rencontre une forte opposition des habitants, Catalans français et espagnols[11]. Les blocs de pierre posés sur la route n'empêchent cependant pas certains véhicules de la contourner par des pistes[12]. En , une demande de réouverture est refusée. Le préfet doit cependant réévaluer la situation[13]. L'association Albères sans frontières, créée en juillet 2022, réunit plus de 1 200 adhérents et exige la réouverture du col[14].
↑« Pyrénées : la fermeture de la route transfrontalière du col de Banyuls fait toujours polémique », Ouest-France, (ISSN1760-6454, lire en ligne, consulté le )