Der Bahnhof Niederzwehren wurde im Zuge des am 15. März 1880 erfolgten Anschlusses der Lossetalbahn an den Hauptbahnhof Kassel als Haltepunkt im Personenverkehr eröffnet. Der Bahnhof war mit Bahnhofs-Namensschild und Fahrplan-Aushang minimal ausgestattet, ein Empfangsgebäude oder Wetterschutzhäuschen gab es dort nie. Der Personenverkehr auf dieser Strecke wurde am 31. Mai 1985 eingestellt, der Zugang zum Inselbahnsteig zugemauert.
Bis heute erhalten ist der Anschluss zum jetzigen Heizkraftwerk Kassel, das über eine Anschlussbahn angebunden ist, die am östlichen Bahnhofsende in südlicher Richtung abzweigt. Für das Heizkraftwerk wird Braunkohle in Selbstentladewagen angeliefert, die gegenwärtig als Ganzzüge von DB Schenker bis ins Kraftwerksgelände zugestellt werden. Früher wurden die Wagen in Niederzwehren von Werkloks des Kraftwerks übernommen.
Der Bahnhof Kassel-Niederzwehren ist mittlerweile Teil des Stammsitzes des Kasseler Traditionsunternehmens W. & L. Jordan GmbH, welches bundesweit führender Bodenbelag-Großhändler ist.
