Regeringen Jonathan Motzfeldt V var Grønlands femte regering som sad fra 7. juni 1988 til 17. marts 1991. Regeringen var en mindretalsregering med 5 landsstyremedlemmer fra Siumut.[1]
Knap et år efter at den forrige regeringskoalition mellem Siumut og Inuit Ataqatigiit var dannet i juni 1987, blussede de to partiers uenigheder op igen under den grønlandske valgḱamp til folketingsvalget i maj 1988. Uenighederne drejede sig denne gang om Grønlands medlemskab af NATO og uranudvinding i Kuannersuit, og både Atassut og Issittup Partiia gav tilsagn om at ville støtte en Siumut-mindretalsregering uden Inuit Ataqatigiit.[2] Den nye regering med kun 5 Siumut landsstyremedlemmer blev godkendt i Landstinget 7. juni 1988[3] af alle partier på nær IA.[4]
Landsstyret bestod af disse medlemmer:[1][4]
Jens Lyberth fratrådte 1. februar 1991 for at blive ny direktør i KNR. Landsstyreformand Jonathan Motzfeldt overtog hans opgaver i regeringens sidste uger (der var ordinært landstingsvalg 5. marts 1991).[5]