Довжина автобуса і пасажиромісткість більше, ніж у МАЗ-256, але менше, ніж у міських автобусів класу МАЗ-103. МАЗ-206 може застосовуватися на не надто завантажених міських маршрутах, в якості службового або VIP-автобуса, а також на приміських маршрутах.
Автобус має низьку підлогу в передній частині, де розташований великий накопичувальний майданчик з місцем для інвалідного візка, а також невелика кількість сидінь. Відразу за другими дверима рівень підлоги підвищується — тут розташовані по два ряди сидінь з кожного боку. Усього є 25 сидячих місць.
Автобус оснащується двигуном Д-245.30 виробництва ММЗ МЗ потужністю 154 к.с., Deutz BF4M1013FC потужністю 170 к.с. або OM 904LA «Мерседес» потужністю 177 к.с., 6-ступінчастою гідромеханічної АКПП виробництва ZF серії Ecomat 4 або 6-ступінчастою МКППZF 6S700BO. Всі двигуни — рядні 4-циліндрові турбодизелі, автоматична коробка передач 6HP 504C — з гідротрансформатором, гідравлічним сповільнювачем і трьома планетарними рядами, ручна КПП — синхронізована з прямою 5-ю і підвищувальною 6-ю передачами.