Каріоферин, ізоформа бета-1

Каріоферин, ізоформа бета-1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1F59, 1IBR, 1M5N, 1O6O, 1O6P, 1QGK, 1QGR, 2P8Q, 2Q5D, 2QNA, 3LWW, 3W5K
Ідентифікатори
Символи	KPNB1, IMB1, IPO1, IPOB, Impnb, NTF97, karyopherin subunit beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602738 MGI: 107532 HomoloGene: 1707 GeneCards: KPNB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• Hsp90 protein binding; • protein domain specific binding; • zinc ion binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nuclear localization sequence binding; • enzyme binding; • RNA binding; • importin-alpha family protein binding;
Клітинна компонента	• ядерна мембрана; • мембрана; • nuclear periphery; • ядерна пора; • endoplasmic reticulum tubular network; • нуклеоплазма; • екзосома; • клітинне ядро; • nuclear envelope; • extracellular region; • цитоплазма; • гіалоплазма; • specific granule lumen; • ficolin-1-rich granule lumen; • host cell; • cytoplasmic stress granule; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• GO:0046795 intracellular transport of virus; • apoptotic DNA fragmentation; • Ran protein signal transduction; • establishment of protein localization; • mitotic spindle assembly; • protein transport; • mitotic metaphase plate congression; • intracellular protein transport; • astral microtubule organization; • mitotic chromosome movement towards spindle pole; • establishment of mitotic spindle localization; • NLS-bearing protein import into nucleus; • modulation by virus of host cellular process; • protein import into nucleus; • ribosomal protein import into nucleus; • GO:0022415 viral process; • neutrophil degranulation; • regulation of cholesterol biosynthetic process; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3837
	16211
	ENSG00000108424
	ENSMUSG00000001440
	Q14974
	P70168
	NM_002265; NM_001276453
	NM_008379
	NP_001263382; NP_002256
	NP_032405
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Каріоферин, ізоформа бета-1 (англ. Karyopherin subunit beta 1) – білок, який кодується геном KPNB1, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 876 амінокислот, а молекулярна маса — 97 170^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELITILEKT	VSPDRLELEA	AQKFLERAAV	ENLPTFLVEL	SRVLANPGNS
QVARVAAGLQ	IKNSLTSKDP	DIKAQYQQRW	LAIDANARRE	VKNYVLQTLG
TETYRPSSAS	QCVAGIACAE	IPVNQWPELI	PQLVANVTNP	NSTEHMKEST
LEAIGYICQD	IDPEQLQDKS	NEILTAIIQG	MRKEEPSNNV	KLAATNALLN
SLEFTKANFD	KESERHFIMQ	VVCEATQCPD	TRVRVAALQN	LVKIMSLYYQ
YMETYMGPAL	FAITIEAMKS	DIDEVALQGI	EFWSNVCDEE	MDLAIEASEA
AEQGRPPEHT	SKFYAKGALQ	YLVPILTQTL	TKQDENDDDD	DWNPCKAAGV
CLMLLATCCE	DDIVPHVLPF	IKEHIKNPDW	RYRDAAVMAF	GCILEGPEPS
QLKPLVIQAM	PTLIELMKDP	SVVVRDTAAW	TVGRICELLP	EAAINDVYLA
PLLQCLIEGL	SAEPRVASNV	CWAFSSLAEA	AYEAADVADD	QEEPATYCLS
SSFELIVQKL	LETTDRPDGH	QNNLRSSAYE	SLMEIVKNSA	KDCYPAVQKT
TLVIMERLQQ	VLQMESHIQS	TSDRIQFNDL	QSLLCATLQN	VLRKVQHQDA
LQISDVVMAS	LLRMFQSTAG	SGGVQEDALM	AVSTLVEVLG	GEFLKYMEAF
KPFLGIGLKN	YAEYQVCLAA	VGLVGDLCRA	LQSNIIPFCD	EVMQLLLENL
GNENVHRSVK	PQILSVFGDI	ALAIGGEFKK	YLEVVLNTLQ	QASQAQVDKS
DYDMVDYLNE	LRESCLEAYT	GIVQGLKGDQ	ENVHPDVMLV	QPRVEFILSF
IDHIAGDEDH	TDGVVACAAG	LIGDLCTAFG	KDVLKLVEAR	PMIHELLTEG
RRSKTNKAKT	LATWATKELR	KLKNQA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Chi N.C., Adam E.J.H., Adam S.A. (1995). Sequence and characterization of cytoplasmic nuclear protein import factor p97. J. Cell Biol. 130: 265—274. PMID 7615630 doi:10.1083/jcb.130.2.265
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Moroianu J., Blobel G., Radu A. (1996). Nuclear protein import: Ran-GTP dissociates the karyopherin alphabeta heterodimer by displacing alpha from an overlapping binding site on beta. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 7059—7062. PMID 8692944 doi:10.1073/pnas.93.14.7059
Henderson B.R., Percipalle P. (1997). Interactions between HIV Rev and nuclear import and export factors: the Rev nuclear localisation signal mediates specific binding to human importin-beta. J. Mol. Biol. 274: 693—707. PMID 9405152 doi:10.1006/jmbi.1997.1420
Jaekel S., Goerlich D. (1998). Importin beta, transportin, RanBP5 and RanBP7 mediate nuclear import of ribosomal proteins in mammalian cells. EMBO J. 17: 4491—4502. PMID 9687515 doi:10.1093/emboj/17.15.4491
Truant R., Cullen B.R. (1999). The arginine-rich domains present in human immunodeficiency virus type 1 Tat and Rev function as direct importin beta-dependent nuclear localization signals. Mol. Cell. Biol. 19: 1210—1217. PMID 9891055 doi:10.1128/MCB.19.2.1210

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6400 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q14974 (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2016. Процитовано 30 січня 2017.