Після входження до складу ВМС «Козак» був включений у 4-у флотилію (командир флотилії капітан Кресуолл), що входила до складу британського Середземноморського флоту.
7 листопада 1939 року «Козак» зіткнувся з «SS Borthwick». Загинули четверо моряків, корабель був змушений вирушити на ремонт, котрий тривав до початку січня 1940 року.
13 жовтня 1940 року бою в районі Еґерсунна «Козак» торпедами відправив на дно мережевий загороджувач «Генуя» (1949 брт) та разом з іншими кораблями знищив допоміжне судно «Нетце» (1025 брт).
Уночі 27 травня 1941 року «Козак» спільно з однотипними «Сікхом», «Зулу» та «Маорі» зробив безуспішну спробу атаки німецького лінкора «Бісмарк». Проте атаку в певному сенсі можна вважати вдалою, бо «Бісмарк» втратив майже годину часу і дорогоцінне пальне, маневруючи на повному ходу і, пізніше того ж дня, був знищений лінкорами «Родні» та «Кінг Джордж V», що підійшли.
Загибель
23 жовтня1941 року «Козак» був торпедований німецьким підводним човном U-563, та, після безуспішних спроб буксирування під час штормової погоди, затонув на північному заході від Гібралтару 27 жовтня 1941 року. Внаслідок торпедної атаки загинули 159 членів команди.
Цікаві факти
Після потоплення «Бісмарка» на борт «Козака» був піднятий кіт, який належав команді німецького лінкора, відомий під прізвиськом «Непотоплюваний Сем». Цьому коту судилося пережити три кораблі, на яких він «служив».