Був заснований 17 листопада 1895 року (хоча клуб святкує своє заснування 15 листопада, що також є бразильським національним святом) як клуб з веслування. «Фламенгу» тільки почав займатись футболом, коли група незадоволених гравців з «Флуміненсе» пішли з клубу після суперечки з правлінням, і футбольна команда офіційно була створена 24 грудня 1911 року.
Перший офіційний матч був зіграний 3 травня 1912 року. Перше дербіFla-Flu (який в стане одним з найвідоміших футбольних дербі у світі), також зіграно у цьому році, 7 липня, і закінчилось перемогою «Флуміненсе» 3-2.
Їх найбільші суперники — три інші топ-клуби з Ріо-де-Жанейро: «Флуміненсе», «Ботафогу» і «Васко да Гама». В даний час, «Васко да Гама» вважається найбільшим суперником, але інтенсивність суперництва у футболі в Ріо змінювалося протягом багатьох поколінь: протягом 1960-х років, наприклад, прихильники «Фламенгу» вважали «Ботафогу» суперником клубу, хоча найбільше суперництво історично склалося з «Флуміненсе», беручи початок з запровадження футболу в клубі, в 1912 році.