TRNK (citidin34-2'-O)-metiltransferaza

TRNK (citidin^34-2'-O)-metiltransferaza
Identifikatori
EC broj	2.1.1.207
IntEnz	IntEnz view
BRENDA	BRENDA entry
ExPASy	NiceZyme view
KEGG	KEGG entry
MetaCyc	metabolic pathway
PRIAM	profile
PDB	RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Pretraga PMC articles PubMed articles NCBI Protein search

TRNK (citidin³⁴-2'-O)-metiltransferaza (EC 2.1.1.207, yibK (gen), metiltransferaza yibK, TrmL, tRNK metiltransferaza L, tRNK (citidin³⁴/5-karboksimetilaminometiluridin³⁴-2'-O)-metiltransferaza) je enzim sa sistematskim imenom S-adenozil-L-metionin:tRNK (citidin³⁴/5-karboksimetilaminometiluridin34-2'-O)-metiltransferaza.^[1] Ovaj enzim katalizuje sledeću hemijsku reakciju

(1) S-adenozil-L-metionin + citidin³⁴ u tRNK ${\displaystyle \rightleftharpoons }$ S-adenozil-L-homocistein + 2'-O-metilcitidin³⁴ u tRNK

(2) S-adenozil-L-metionin + 5-karboksimetilaminometiluridin³⁴ u tRNKLeu ${\displaystyle \rightleftharpoons }$ S-adenozil-L-homocistein + 5-karboksimetilaminometil-2'-O-metiluridin³⁴ u tRNKLeu

Enzim iz Escherichia coli katalizuje 2'-O-metilaciju citidina ili 5-karboksimetilaminometiluridina u pokretnoj poziciji na nukleotidu 34 u tRNKLeuCmAA i tRNKLeucmnm5UmAA. Ovaj enzim je selektivan za dva tRNKLeu izoakceptora i jedino ih metiliše kad su prisutni u korektnoj antikodonskoj sekvenci petlje i modifikacionog obrasca. Specifično, za dejstvo YibK je neophodan pirimidinski nukleozid u poziciji 34.

Reference

1. Benitez-Paez, A., Villarroya, M., Douthwaite, S., Gabaldon, T. and Armengod, M.E. (2010). „YibK is the 2′-O-methyltransferase TrmL that modifies the wobble nucleotide in Escherichia coli tRNA(Leu) isoacceptors”. RNA 16: 2131-2143. PMID 20855540. 

Literatura

• Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
• Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
• Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0. 
• Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 
• Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X. 
• Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842. 

Vanjske veze

• MeSH TRNA+(cytidine34-2'-O)-methyltransferase