Мальтотриоза представляет собой трисахарид (сахар из трёх субъединиц), состоящий из трёх молекул глюкозы, соединенных α-1,4 гликозидными связями.
Чаще всего её получают посредством пищеварительного фермента альфа-амилазы (обычный фермент в слюне человека для преобразования амилозы в крахмале). Получение мальтотриозы и мальтозы в этом процессе происходит случайным образом, когда альфа-амилаза гидролизует α-1,4 гликозидные связи.