Por serem pouco desenvolvidos, esses solos são cobertos pela Caatinga, cujas espécies são de pequeno porte e adaptadas ao clima semiárido local.[5] Na hidrografia, Jandaíra se insere totalmente na faixa litorânea norte de escoamento difuso,[5] com pequenos corpos hídricos que escoam em direção ao oceano, sem que haja uma área de drenagem delimitada pelos divisores de águas como nas bacias hidrográficas.[8] Cortam o território municipal os riachos Baixa Branca, do Boi, da Mutuca, São Sebastião e Tubibau.[5]
O índice pluviométrico é baixo, de apenas 490 mm/ano, sendo março e abril os meses mais chuvosos.[9] Segundo dados da Empresa de Pesquisa Agropecuária do Rio Grande do Norte (EMPARN), que possui dados pluviométricos de Jandaíra desde 1962, o maior acumulado de precipitação em 24 horas atingiu 175 mm em 17 de fevereiro de 1988.[9] Desde dezembro de 2019, quando entrou em operação uma estação meteorológica automática da EMPARN na cidade, a menor temperatura ocorreu em 14 de junho de 2022 (18,4 °C) e a maior em 13 de novembro de 2021 (38,9 °C).[10]
Sendo um município do Brasil, Jandaíra é administrado por dois poderes, o executivo e o legislativo, independentes e harmônicos entre si. O primeiro é representado pelo prefeito, auxiliado pelo seu gabinete de secretários e eleito pelo voto popular para um mandato de quatro anos, sendo permitida uma única reeleição para mais um mandato consecutivo, enquanto que o segundo é representado pela Câmara Municipal de Jandaíra, órgão colegiado de representação dos munícipes que é composto por vereadores também eleitos por sufrágio universal.[11]
As atuais autoridades que ocupam cargos da organização político-administrativa de Jandaíra são as seguintes (data: 1 de janeiro de 2025):
