Muižas latviskais nosaukums ir cēlies no tās agrāko īpašnieku Bērensu fon Rautenfeldu, tautā sauktu par Bieriņiem, uzvārda.
Vecā Bieriņu muižas ēka celta ap 1800. gadu un tā atradās tagadējā Kantora ielā 97 Mārupes novadā (tagad ir pilnīgi iebūvēta jaunajā Mārupes vidusskolas ēkā). Ap 1870. gadu muižas īpašnieki uzcēla jaunu ēku tagadējā Kantora ielā 10, Mārupītes un tās attekas Bieriņgrāvja ielokā. Bieriņu muižu pārvaldīja secīgi Heinrihs Eberhards Bērenss fon Rautenfelds (1822—1895), Heinrihs Augusts Bērenss fon Rautenfelds (1850—1896) un viņa atraitne Teofila Anna Margarēte Bērensa fon Rautenfelde. Pēdējā Bieriņmuižas īpašniece pēc Heinriha Augusta Berensa fon Rautenfelda nāves 1923. gadā bija viņa sieva Elizabete Emīlija, dzimusi Kuģenieks.[1]
Pēc 1920. gada zemes reformas 1924. gadā Bieriņu muižas ēka ar aptuveni 11 ha zemes tika piešķirta Elizabetei Emīlijai kopā ar viņu diviem dēliem un pēc pārbūves 1928. gadā viņa muižas ēkā izveidoja īres namu ar 14 dzīvokļiem.
21. gadsimta sākumā muižas ēka bija diezgan nolaista, ar nesakoptu apkārtni, tomēr vēl senatnīgi majestātiska un pa gabalu izcēlās parka ainavā. Māja un zemes nogabals bija atdots atpakaļ Rautenfeldu ģimenei.[2] 2018. gada rudenī Bieriņu muižas senās ēkas, kas atradās sliktā stāvoklī, tika nojauktas. 2022. gadā ēkas vietā oriģinālam līdzīgā veidolā uzcelts dzīvokļu nams "Jaunā Bieriņmuiža".[3][4]