Teritorija nuo seno klestėjo įvairios kultūros – Čavino, Vario, Čankų. Čia buvo išgaunamas gyvsidabris. Inkai užkariavo Huankaveliką valdant Tupakui Jupankiui ir Pačakutekui. Ispanų valdymo laikais šis kraštas buvo svarbus kalnakasybos centras, garsėjęs cinoberio, gyvsidabrio, aukso telkiniais, tačiau XVIII a. Huankavelika nuskurdo. 1822 m. sudarytas Huankavelikos departamentas. 1926 m. šį kraštą pasiekė geležinkelis.
Geografija
Visa departamento teritorija yra Andų kalnuose. Aukščiausi gūbriai iškilę pietvakariuose, likusioje dalyje plyti plokščiakalniai. Svarbiausios viršūnės: Huamanrasas (5298 m), Chahinija (5288 m), Altaras (5268 m) ir kt.
Dalis upių priklauso Apurimako baseinui (Mantaras, Pampa), kitos teka į Ramųjį vandenyną (Piskas). Gausu nedidelių kalnų ežerų (Čoklokoča, Orkokoča, Huarmikoča, Janakoča, Tajakoča ir kt.).
Klimatas aukštikalnių, vėsus. Vidutinė metinė oro temperatūra yra 9 °C, metų bėgyje keičiasi nedaug. Dienomis įšyla virš 23 °C, naktį atvėsta iki 5 °C. Dauguma kritulių iškrenta nuo sausio iki kovo, neretas sniegas, kruša.