쓰쿠바시(일본어: つくば市, 문화어: 쯔꾸바시)는 이바라키현에 자리한 연구와 교육을 위한 계획 도시이다. 간토평야 동쪽, 쓰쿠바 산의 남쪽 기슭에 위치하고 있다. 도쿄의 위성도시로, 2007년 4월 1일 특례시로 지정되었다.
국책에 의해서 건설된 계획도시 "쓰쿠바 연구 학원 도시"로 이루어져있다. 시의 동부에서 남북으로 펼쳐진 "연구 학원 지구"와 그 주위에 있는 "주변 개발 지구"로 나눌 수 있고 주변 개발 지구 안에서도 쓰쿠바 익스프레스의 역을 중심으로 뉴 타운이 형성되고 있다. 그 이외에는 농지, 산림이나 취락등에서 구성된다. 박사 학위 취득자가 약 5,600명으로 인구에 비해 많고 약 300개의 연구기관, 기업과 약 1만 3천명의 연구자가 있어 세계 유수한 학술, 연구 도시가 되어 있다. 직주근접을 실현한 도시이지만 쓰쿠바 익스프레스 연선의 개발로 최근에는 도쿄 도 구부의 주택 지역으로서의 측면도 있다.
쓰쿠바 시는 도쿄 도심에서 약 45~65km, 이바라키 현 남부에 위치한다. 시의 남서쪽에서 중앙부에 걸쳐 수도권 신도시 철도 쓰쿠바 익스프레스, 조반 자동차도가 통과하고 동서에는 수도권 중앙 연락 자동차도(겐오 자동차도)가 일부 개통되어 있다. 또 쓰쿠바 익스프레스에 병행해 정비가 진행되고 있는 신도시 중앙도로가 일부 구간이 개통되어 있다.
관광지로 유명한 쓰쿠바 산은 시 북부에 위치한다. 쓰쿠바산 주변을 제외하고는 쓰쿠바·도부 대지로 불리는 높이 20~30m의 평탄한 지형이며 간토 롬층으로 덮여 있다.
연평균 기온은 13.5°C이고 연평균 강수량은 1235.6mm이다(1971~2000년의 평년치).
남북조 시대에는 오다 씨가 시 북부에 오다 성을 쌓고 본거지로 했다. 이 오다씨의 인연으로 기타바타케 지카후사가 오다 성에 들어와 신황정통기를 저술했다. 오사카 전투 때 전공이 있던 호소카와 오키모토가 옛 야나베 정에 1만 6000석을 받아 에도 시대의 에도 막부 말기까지 이곳을 다스렸다. 통칭 야타베 번으로 불리고 히고 호소카와 가의 분가이다.
2005년 8월 24일 수도권 신도시 철도가 운영하는 쓰쿠바 익스프레스(약칭 TX)가 개통되었다. 쓰쿠바 역에서 도쿄의 아키하바라역까지 45분만에 빠른 속도로 연결해 준다.
TX가 있는 동일한 지역에 위치한 버스센터는 인근 도시를 연결하는 유용한 교통 수단이다. 가장 가까운 주요 공항은 나리타 국제공항이며, 버스를 통해 접근할 수 있다. 고속도로로는 조반 자동차도, 겐오 자동차도가 통과하고 국도로는 6호선, 125호선, 354호선, 408호선, 468호선이 통과한다.