Аллель (гр. ἀλλήλων өз ара) — ұқсас хромосомалардың сәйкес локустарына (ген орны) орналасқан және тек бір белгінің дамуына әсер ететін гендер.
Хромосомадағы барлық локустардың құрылысы бірдей емес, олардың әрқайсысына әртүрлі гендер орналасады. Әрбір ген құрылысына байланысты екі аллель түрінде болады, оның бірінің басымдылық қасиеті болып белгілі бір белгіні дамытады (мысалы, гүлдің түсі), ал екіншісі осы әсерді жартылай не тіпті түгелдей жояды (мысалы, реңсіз гүл). Аллель гендер саны екіден артық болуы да жиі кездеседі, сондықтан үштен жиырмаға дейін әртүрлі фенотиптер пайда болуы мүмкін.[1]