I sorteggi del secondo turno si sono svolti il 14 aprile 2015 a Kuala Lumpur. Le prime classificate e le migliori 4 seconde si qualificano alla Coppa d'Asia 2019.
Avanza al terzo turno di qualificazione della Coppa d'Asia come una delle quattro peggiori seconde classificate, terza classificata o una delle quattro migliori quarte classificate.
Avanza ai playoff di qualificazione della Coppa d'Asia.
Denomina una squadra che è stata squalificata a seguito di una precedente sospensione FIFA.
Le quattro migliori seconde classificate ottengono la qualificazione al terzo round delle qualificazioni del campionato mondiale di calcio 2018 e alla Coppa d'Asia 2019, mentre le altre dovranno partecipare ad un nuovo torneo delle qualificazioni. Dato che il gruppo F è composto da quattro squadre, mentre negli altri gruppi ve ne sono cinque, le partite contro le squadre classificatesi al quinto posto degli altri gironi non sono valide per il conteggio dei punti delle migliori seconde classificate.
Le quattro migliori quarte classificate ottengono la qualificazione al terzo round, mentre le altre devono disputare un turno di playoff. Dato che il gruppo F è composto da quattro squadre, mentre negli altri gruppi ve ne sono cinque, le partite contro le squadre classificatesi al quinto posto degli altri gironi non sono valide per il conteggio dei punti delle migliori quarte classificate.
Durante l'AFC Competition Committee meeting che si è tenuto nel novembre 2014 è stato deciso che si sarebbero svolti due turni playoff per l'assegnazione degli ultimi 8 posti disponibili per il terzo turno (5 dal primo turno di playoff, 3 dal secondo).
Il sorteggio è stato effettuato il 7 aprile 2016 alle 15:00 UTC+8 presso la AFC House a Kuala Lumpur, Malaysia
Primo turno
Il Bhutan, la nazionale con il ranking peggiore, ha ricevuto un bye.
I vincitori delle doppie sfide andata e ritorno si qualificano direttamente per il terzo turno della qualificazioni alla Coppa d'Asia 2019 mentre i perdenti disputeranno il secondo turno.
A causa del ritiro di Guam e della sospensione del Kuwait, l'AFC ha deciso di invitare il Nepal e Macao, le finaliste della Coppa della solidarietà AFC 2016, a rientrare nelle qualificazioni come sostitute per mantenere un numero di 24 squadre nel terzo turno delle qualificazioni.
Il sorteggio per il terzo turno si è tenuto il 23 gennaio 2017 ad Abu Dhabi negli Emirati Arabi Uniti alle 16:00 UTC+4. Le 24 nazioni sono state divise in sei gruppi ciascuno di quattro squadre.