Questa voce raccoglie le informazioni riguardanti il Fußball-Club Bayern München nelle competizioni ufficiali della stagione 1988-1989.
Prima dell'inizio della stagione avvengono alcuni movimenti di calciomercato: la porta non è più difesa da Jean-Marie Pfaff ma da quello che era il suo vice, Raimond Aumann, inoltre dall'Empoli arriva Johnny Ekström; infine Andreas Brehme e Lothar Matthäus passano all'Inter.
. Il Bayern non fa molta strada nella Coppa di Germania, dove viene eliminata nel terzo turno dal Karlsruhe, mentre di rilievo è il cammino nella Coppa UEFA. In questa manifestazione i tedeschi arrivano agli ottavi di finale vincendo tutte le partite, e qui trovano l'Inter: l'incontro di andata, giocato a Monaco, verrà ricordato anche per il bel gol di Nicola Berti[1] che, intercettata la palla poco fuori dalla propria area di rigore fugge inseguito dai giocatori tedeschi verso la porta difesa da Aumann, riuscendo poi a batterlo. La squadra italiana riesce a vincere l'incontro 2-0, ma la situazione cambia al termine della partita di Milano: i Rossi segnano tre gol in sette minuti, e riescono a qualificarsi grazie alla vittoria finale per 3-1. I tedeschi vengono eliminati in semifinale dal Napoli capitanato da Diego Armando Maradona che vincerà poi il trofeo: i partenopei vincono 2-0 l'andata in casa, mentre nel ritorno in Germania Ovest il pareggio per 2-2 è fatale ai padroni di casa. La stagione termina comunque con la conquista dell'undicesimo titolo tedesco, il quarto in cinque anni; qui la squadra stacca il Colonia di cinque punti, mentre Roland Wohlfarth è capocannoniere.
Area direttiva
Area tecnica
Legenda: Luogo: C = Casa; T = Trasferta. Risultato: V = Vittoria; N = Pareggio; P = Sconfitta.