Il 1º luglio 1885 Nikisch sposò Amelie Heussner (1862-1938), una cantante ed attrice, che era stata fidanzata, negli anni precedenti, con Gustav Mahler.
Egli fu un pioniere in molti campi. Nel 1912 portò la London Symphony Orchestra in tournée negli Stati Uniti, la prima volta per un'orchestra europea. Nel 1913, effettuò la prima registrazione commerciale di una intera sinfonia, la Sinfonia n. 5 di Beethoven, con i Berliner Philharmoniker, registrazione poi incisa su LP e CD dalla EMI. Fece anche una serie di prime registrazioni con la London Symphony Orchestra.
Morì a Lipsia nel 1922 ed immediatamente dopo la sua morte, la piazza in cui abitò venne rinominata Nikischplatz, e nel 1971 la città di Lipsia creò il Premio Arthur Nikisch per giovani direttori d'orchestra.
Egli è riconosciuto come uno dei pionieri delle moderna direzione d'orchestra, per la sua profonda analisi dello spartito, ed il carisma che lui portò nella piena sonorità dell'orchestra e la capacità di entrare in profondità nelle opere dirette. Fra gli estimatori di Nikisch vi furono grandi direttori d'orchestra come Leopold Stokowski, Arturo Toscanini, Fritz Stein, Sir Adrian Boult e Fritz Reiner. Un giorno Reiner disse: "Nikisch mi disse che non avrei dovuto dimenare le braccia mentre dirigevo, ma avrei dovuto usare gli occhi per dare indicazioni agli orchestrali."[1]