A Fradiban először 5-ös mezben játszott, rögtön egy rangadóval kezdett, melyet az Újpest ellenében megnyert a Fradi 5-0-ra a Megyeri úton. Péter hosszú hajjal mutatkozott be, és a tévében Lipcsei Péter helyett Lipcsei Csabát írtak ki. Első NB 1-es gólját 1990. november 17-én, a Békéscsaba ellen 4-0-ra megnyert mérkőzésen szerezte. Limperger Zsolt tisztelete miatt később már 6-osban játszott. Péternek a továbbiakban is sok sikerben volt része. Az 1990-es évek első felében egyértelmű vezéregyénisége volt a Fradinak, szinte védjegyévé vált az, ahogy egy-egy hosszú cselsorozat végén, mindenkit elfektetve talált rendre a kapuba. 1991-ben az év magyar labdarúgója elismeréssel díjazták teljesítményét. Az 1992-esKEK sorozat gólkirálya. Albert Flórián után a második legeredményesebb Fradi játékos, az UEFA kupában pedig senki nem játszott annyi meccset az FTC-ből, mint ő.
Nem csoda, hogy 1995-ben leigazolta a világhírű FC Porto, amelyben sérüléséig klasszis teljesítményt nyújtott. Első évében bajnokságot és szuperkupát nyert a Portóval és a Bajnokok Ligájában a Nantes elleni meccset végig játszotta.[1] Sérülése után nem adta fel és 1997-ben illetve 2000-ben ismét visszatért az Üllői útra.
Az 58-szoros magyar válogatott játékos négyszer lett magyar bajnok, hatszor kupagyőztes, míg a Szuper Kupának háromszor örülhetett. Több mint ötszázszor ölthette magára a zöld-fehér mezt - a jubileumot gólpasszal tette emlékezetessé. A Ferencváros egyik vezéregyénisége volt az NB II-ben is, ő végzett a kanadai tabella élén, elsősorban gólpasszainak köszönhetően. A 2008–2009-es szezont is kitűnő formában kezdte meg. Az első három fordulóban öt gólpasszt osztott ki, amikor is a Békéscsaba elleni Üllői-úti bajnoki vége felé ütközött a kapussal. Lábában elszakadtak az oldal- és keresztszalagok. 6-7 hónapos kihagyás után 2009 áprilisában tért vissza a csapatba, jobbára csak csereként játszva. 2010. május 15-én a Diósgyőr ellen 1–0-ra megnyert idegenbeli bajnokin Lipcsei beállította Dr. Sárosi György 646 meccses klubrekordját a Ferencvárosban lejátszott meccseket tekintve.[2] A szezon utolsó mérkőzésén, a Honvéd ellen játszotta 648. mérkőzését a Fradiban, ezzel csúcstartó lett, majd visszavonult az aktív játéktól. Így profi karrierje pontosan 20 évig tartott.[3]
A szerződése 2012. június 30-ig volt érvényes az FTC-vel, 2010. május 15-e után mint edző tevékenykedett.
2013. március 24-én az Albert Flórián Stadion búcsúztatója egyben a Fradi néhány meghatározó játékosának is a búcsúmeccse volt. A szurkolók nem csak a legendás stadiontól köszönhettek el, hanem az elmúlt évtizedek meghatározó játékosaitól is. A Kolozsvár elleni gálameccsen többek között Keller József, Rósa Dénes, Dragóner Attila, Balog Zoltán, Lisztes Krisztián és a Ferencvárosban 649. alkalommal szereplő Lipcsei Péter is a csapatot alkotta.[4][5][6]
A válogatottban
58-szoros válogatott, 1991-ben mutatkozott be, Írország ellen. Egyetlen gólt lőtt, Máltának.
.svg){kind=small}
