Le parti est fondé le par des membres de l'aile droite du Mouvement réformateur (Sąjūdis), dirigés par le premier chef d'État de la Lituanie indépendante, Vytautas Landsbergis. Il prend le nom d'Union patriotique, conservateurs lituaniens (Tėvynės Sąjunga (Lietuvos konservatoriai), TS-LK).
En 1999, Rolandas Paksas, issu de la TS-LK, remplace Vagnorius et prend la direction d'un gouvernement minoritaire. Moins de trois semaines après son investiture, quatre députés quittent la formation pour fonder le Parti populaire de la patrie (TLP). Paksas démissionne au bout de cinq mois, au profit d'Andrius Kubilius, qui forme à son tour un gouvernement minoritaire.
La TS-LK subit un important échec aux élections législatives d'octobre 2002, avec seulement 8,6 % des suffrages et neuf députés sur 141. Le parti rejoint alors l'opposition, à Rolandas Paksas d'abord, puis au social-démocrate Algirdas Brazauskas ensuite. En 2003, Vytautas Landsbergis abandonne la présidence de l'Union patriotique à Andrius Kubilius. Lors des élections européennes de , le parti devient la troisième force du pays, obtenant 12,6 % des suffrages et deux députés sur 13, dont Landsbergis. Il confirme son statut aux législatives d'octobre suivant, se classant troisième avec 14,8 % des voix et 25 sièges.
La TS-LK fusionne peu après l'Union des prisonniers politiques et des déportés lituaniens (LPKTS) et prend alors le nom d'Union patriotique, conservateurs, prisonniers politiques et déportés, chrétiens-démocrates (Tėvynės Sąjunga (konservatoriai, politiniai kaliniai ir tremtiniai, krikščioniškieji demokratai)). Devenue le premier parti politique de Lituanie, la TS accepte, le , de fusionner avec les Chrétiens-démocrates lituaniens. La formation se rebaptise alors Union patriotique - Chrétiens-démocrates lituaniens (conservateurs, prisonniers politiques et déportés, nationalistes) (Tėvynės sąjunga – Lietuvos krikščionys demokratai (konservatoriai, politiniai kaliniai ir tremtiniai, tautininkai)). Kubilius est confirmé à la présidence, le président des LKD, Valentinas Stundys, étant élu vice-président.
Retour au pouvoir
Désormais principale force du centre droit, la TS-LKD s'impose aux élections législatives d'octobre 2008 avec 19,7 % des suffrages et 45 députés. Kubilius parvenant à former une coalition avec deux partis libéraux et un parti conservateur, il redevient Premier ministre en décembre suivant. Aux élections européennes de , le parti se maintient en première place, avec 26,2 % et quatre députés sur 12 au Parlement européen. Quatre mois plus tard, l'indépendante Dalia Grybauskaitė, soutenue par la coalition au pouvoir, remporte la présidentielle avec 69 % des suffrages dès le premier tour.