Les premiers Six Jours de Rotterdam sont organisés en 1936 et 1937, sur une piste déplacée de l'Oude-RAI d'Amsterdam au Nenyto de Rotterdam après l'échec des Six Jours d'Amsterdam. Ils n'ont ensuite plus lieu pendant 30 ans. Ils réapparaissent en 1968 et sont organisés chaque année jusqu'en 1988. René Pijnen établit son record de dix succès durant ces années.
Après une nouvelle période d'absence longue de seize ans, les Six Jours sont disputés depuis 2005, au mois de janvier, à l'Ahoy Rotterdam. Ils sont organisés par Frank Boelé, organisateur des Six Jours d'Amsterdam, assisté de Patrick Sercu, organisateur des Six Jours de Gand, et de Michael Zijlaard.
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