Après l’enlèvement d'un sergent de l’Armée de l’Air qui gardait la porte des étoiles, le général Hammond convoque le colonel Jack O'Neill pour comprendre d'où venait cette attaque. Ce dernier confesse que la porte n’a pas été détruite sur Abydos lors de sa dernière mission et que le docteur Daniel Jackson est resté là-bas. O’Neill retourne sur Abydos, accompagné de ses vieux camarades Kawalsky et Ferretti, et du capitaine Samantha Carter, une astrophysicienne brillante au service de l’armée. Une fois sur place, Daniel Jackson les informe qu'il a trouvé une Salle des Cartes, qui confirme que la « Porte des Étoiles » peut transporter des personnes vers d'innombrables lieux dans toute la galaxie. Cependant, alors que Daniel fait visiter la salle, son épouse Sha're et son ami Skaara sont enlevés par les mêmes guerriers que ceux qui sont venus sur Terre[2]. Daniel revient sur Terre pour participer à une mission de sauvetage sur la planète d'origine des attaques : Chulak.
Sur Chulak, un garde sépare les jeunes femmes d'un groupe de prisonniers ; Sha're en fait partie malgré les protestations de Skaara.
Sur Terre, Jackson et O'Neill se remémorent leurs souvenirs de la première mission sur Abydos et discutent ensuite sur l'identité du ravisseur : ils arrivent à la conclusion que ce n'est pas Râ. Alors que sur Chulak un être parasitaire ayant l'apparence d'un serpent prend possession du corps de Sha're, le général Hammond créé les neuf premières équipes d'exploration et lance le programme Porte des étoiles. Leur première mission sera d'aller sur Chulak.
De retour de la mission sur Chulak, O’Neill tente de faire intégrer au sein du SGC un extraterrestre qui a sauvé la vie de ses coéquipiers. Ce dernier, nommé Teal'c, est plutôt traité comme un rat de laboratoire parce qu'il a en lui le même type de larve que celle qui parasite le major Kawalsky dans cet épisode[2].
L'équipe SG-1 visite Simarka, une planète habitée par un peuple similaire aux Mongols et qui vit selon un code de loi très strict ; les femmes sont traitées comme des êtres inférieurs qu'on peut vendre comme de la vulgaire marchandise. Carter est enlevée pour être échangée contre une autre femme. Elle se bat alors pour prouver que les hommes ne sont pas supérieurs aux femmes[2].
SG-1 découvre P3X-797, une planète divisée en une terre d’ombre et une terre de lumière. La terre de lumière est peuplée par des humains semblables à ceux de l'âge du bronze, alors que la terre d’ombre est habitée par des êtres primitifs et violents nommés les « atteints » qui attaquent les membres de SG-1. Rentrés sur Terre, ceux-ci se rendent compte qu'ils ont ramené un virus très contagieux ; bientôt, toute la base se retrouve infectée.
L'équipe SG-9 est portée disparue, alors qu'elle était en mission sur une planète. SG-1 est envoyé pour la retrouver. Une fois sur la planète, les membres de SG-1 découvrent que la population locale travaille comme des esclaves pour leur nouveau dieu. Ce dieu n'est autre que le capitaine Jonas Hanson, le responsable de SG-9[3]. Hanson était autrefois épris de Carter et il a toujours un faible pour elle. Carter profite de cette situation pour essayer de le ramener à la raison. De son côté, O'Neill se prépare à attaquer Hanson et ses hommes. Mais Daniel et Teal'c proposent un autre plan pour arrêter Hanson.
En mission sur le monde désertique P3X-562, SG-1 découvre une vallée où sont entassés des cristaux cassés. Jack O'Neill touche le seul cristal intact et reçoit une décharge électrique qui le rend inconscient. Après avoir repris connaissance, le colonel découvre que SG-1 est reparti sans lui : c'est un autre O'Neill qui est rentré sur Terre avec une partie de sa mémoire[3]. Sur Terre, ce faux O'Neill va découvrir et revivre la perte tragique de son fils. Ce personnage symbolise les émotions que le vrai colonel n'a jamais pu exprimer, permettant à la famille entière d'avancer ensemble pour faire face à ce drame qui les a séparés.
Poussés à rechercher de nouvelles technologies, les membres de SG-1 visitent une planète qui, selon Teal’c, abriterait des créatures volantes ayant le pouvoir de se rendre invisibles, les Fenri. En arrivant sur la planète où vivent ces créatures, ils rencontrent Apophis. Ils en profitent pour lui tendre une embuscade, mais tout se déroule mal. O'Neill, Carter et Jackson sont tués. Mais ils sont ramenés à la vie par les Nox, qui sont les véritables détenteurs du pouvoir d'invisibilité. Les Nox sont un peuple totalement pacifique. Ils paraissent assez primitifs et vulnérables. Ils ont aussi ramené à la vie Shak'l, un Jaffa d'Apophis qui n'hésitera pas à révéler l'existence des Nox à son maître dès qu'il sera à nouveau d'aplomb.
SG-1 explore Argos, une planète paradisiaque créé par le dieu Goa'uld nommé Pélops. Les habitants d'Argos vieillissent cependant à une vitesse très élevée et ils ne dépassent guère l'âge de 100 jours. O'Neill est séduit par Kynthia, une magnifique Argosienne. Mais sa relation n’est pas sans conséquence. Il est lui aussi victime du phénomène de vieillissement accéléré et il ne lui reste plus que quelques jours à vivre.
Au cours de ses recherches, Daniel découvre que les Goa'uld ne sont pas les seuls à s'être fait passer pour des dieux. En effet, à côté des dieux oppresseurs, on trouve des dieux beaucoup plus bénéfiques: les dieux vikings, en particulier Thor. Teal'c informe alors le SGC qu'il existe une planète dont aucun Goa'uld n'est jamais revenu: Cimmeria. SG-1 se rend sur place pour y découvrir une arme Asgard : le marteau de Thor.
En regardant des films d'archives, Daniel découvre qu'une équipe de savants a activé la Porte des Étoiles en 1945. Un homme l'a traversée et n'en est jamais revenu. Quand Daniel montre les images à Catherine, la personne qui l'a fait entrer dans le programme Porte des Étoiles, elle reconnaît l'amour de sa vie: Ernest Littlefield. Utilisant la même séquence d'activation de la Porte, SG-1 part avec Catherine à la recherche de ce héros oublié.
Au péril de sa vie, Teal'c retourne sur sa planète natale pour empêcher l'implantation d'une larve de Goa'uld dans le corps de son fils, Rya'c. Arrivé sur Chulak, il découvre que sa famille est proscrite et que son fils est gravement malade[4].
SG-1 revient d'une mission sans Daniel, qu'ils pensent avoir vu brûler vif[5]. En réalité, il est détenu dans une prison sous-marine par un alien amphibie et doit déchiffrer un texte pour découvrir ce qui est arrivé à la compagne de la créature... dans l'antique Babylone ! Cette seule condition lui assurera la vie sauve.
Des archéologues trouvent un sarcophage égyptien dans une tombe maya, et libèrent le Goa'uld Hathor. Se servant de son charme fatal, Hathor entreprend de séduire tous les hommes du SGC pour faire aboutir son plan de domination mondiale.
Sur P3X-1279, Hanno, un villageois, accuse Teal'c d'avoir tué son père. Teal'c est alors jugé lors d'un procès. Cependant, ce procès se déroule très différemment d'un procès terrien ; Hanno est à la fois juge et partie...
Sur P3X-7763, un volcan en éruption expulse des cendres et de la lave ardente aux alentours de la Porte des étoiles. SG-1 rassemble quelques survivants et traverse la Porte vers la Terre. Les rescapés du cataclysme, les Tollan, ne sont pas reconnaissants de leur avoir sauvé la vie. Leur chef, Omoc, qui ne fait pas confiance à une société humaine si primitive, refuse de répondre à toutes les questions à propos de la technologie très avancée de sa planète. Il demande à être renvoyé avec les siens dans un monde similaire du point de vue technologique. Mais le gouvernement ne souhaite pas perdre une occasion d'acquérir de nouvelles technologies.
À la suite d'un dysfonctionnement de la Porte des étoiles, le colonel Jack O'Neill et le capitaine Samantha Carter sont coincés près d'une autre Porte des étoiles dans une crevasse glaciaire sur une planète inconnue.
Sur P3X-989, les membres de SG-1 sont victimes d'un piège électrique qui les rend inconscients. À leur réveil, ils se retrouvent dans un laboratoire souterrain avec Harlan, un habitant de cette planète âgé de 11 000 ans leur disant qu'il a supprimé leurs problèmes et les a améliorés. Quand ils retournent sur Terre, en dépit des recommandations d'Harlan, les membres de l'équipe découvrent ce qu'il voulait dire : ils sont maintenant dans des corps mécaniques immortels.
Sur P3R-233, Daniel Jackson découvre un miroir quantique. En le touchant, il reçoit une légère secousse. Voyant que tous ses coéquipiers ne sont plus là, il retourne sur Terre. Il découvre alors qu'il est dans une réalité alternative[6]. Dans cette réalité, la Terre subit l'offensive des Goa'uld qui s'apprêtent à envahir le SGA (Stargate Alternative / SGC du monde alternatif) après avoir rayé de la carte plusieurs des grandes villes de la Terre.
Après avoir réussi à s'échapper in extremis de la réalité alternative de l'épisode précédent, Daniel informe le SGC de la menace de l'attaque imminente d'Apophis mais il se heurte au sénateur Kinsey qui ne voit dans le programme Porte des Étoiles qu'un gaspillage d'argent et qui considère les déclarations de Daniel comme celles d'un illuminé[7].
La Porte des Étoiles est condamnée, en dépit des avertissements de Daniel concernant une imminente attaque Goa'uld contre la Terre. Cependant, SG-1 défie tous les ordres et fait un voyage non autorisé à travers la Porte des Étoiles vers ce qu'ils pensent être la planète à l'origine de l'attaque. En réalité, ils se retrouvent dans un vaisseau-mère d'Apophis — rempli de guerriers Jaffas — juste avant son départ en hyperespace pour attaquer la Terre sous le commandement de Klorel, qui s'est emparé du corps de Ska'ara.
Musique
The Best of Stargate SG-1 : Season 1 - Original Television Soundtrack[8].