PROFILBARU.COM

Classification LPSN
Domaine	Bacteria
Phylum	Pseudomonadota
Classe	Alphaproteobacteria
Ordre	Rhodobacterales
Famille	Paracoccaceae

Paracoccus est un genre de bactéries gram négatives de la famille des Paracoccaceae.

Historique

Les Paracoccus ont été décrites comme un nouveau genre bactérien lors du rejet du genre Hydrogenomonas lequel était un genre historique créé en 1909 par Sigurd Orla-Jensen^[1].

Description

Les Paracoccus sont des bactéries à coloration de Gram négative. Elles ne forment pas de spores et sont non mobiles^[2]. Elles sont aérobies strictes (sauf si le milieu contient du nitrate). Le métabolisme est respiratoire et non fermentatif. Ces bactéries ont des réactions positives pour les tests catalase et oxydase mais négatives pour l'arginine dihydrolase^[2]. Elles sont hétérotrophes mais elles peuvent être autotrophes facultatives si cela s'accompagne d'une oxydation aérobie d'hydrogène comme source d'énergie^[2].

Le contenu en guanine plus cytosine est de 62 à 67 %^[2].

Taxonomie

Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Paracoccus Davis 1969 (pour Diana Helen Davis)^[3].

L'espèce type est : Paracoccus denitrificans (Beijerinck & Minkman 1910) Davis 1969^[3].

Paracoccus a pour synonyme^[3] :

Thiosphaera Robertson & Kuenen 1984

Étymologie

L'étymologie du nom générique est Pa.ra.coc’cus. Gr. prep. para, à proximité de, ressemblant; N.L. masc. n. coccus, un grain; du nom masculin grec kokkos, grain; N.L. masc. n. Paracoccus, comme un coccus^[3].

Liste des espèces

Selon la LPSN (20 juillet 2024)^[3], le genre Paracoccus comprend 86 espèces publiées de manière valide et au nom correct :

Paracoccus acridae Zhang et al. 2016
Paracoccus aeridis Rai et al. 2020
Paracoccus aerius Xue et al. 2017
Paracoccus aerodenitrificans Zhang et al. 2023
Paracoccus aestuarii Roh et al. 2009
Paracoccus aestuariivivens Park et al. 2016
Paracoccus albicereus He et al. 2023
Paracoccus albus Zhang et al. 2023
Paracoccus alcaliphilus Urakami et al. 1989
Paracoccus alimentarius Kim et al. 2018
Paracoccus alkanivorans Zhang et al. 2020
Paracoccus alkenifer Lipski et al. 1998
Paracoccus aminophilus Urakami et al. 1990
Paracoccus aminovorans Urakami et al. 1990
Paracoccus amoyensis Lyu et al. 2021
Paracoccus angustae Sun et al. 2015
Paracoccus aurantiacus Ye et al. 2020
Paracoccus bengalensis Ghosh et al. 2006
Paracoccus caeni Lee et al. 2011
Paracoccus carotinifaciens Tsubokura et al. 1999
Paracoccus cavernae Dominguez-Moñino et al. 2016
Paracoccus chinensis Li et al. 2009
Paracoccus communis Poroshina et al. 2014
Paracoccus contaminans Kämpfer et al. 2016
Paracoccus denitrificans (Beijerinck & Minkman 1910) Davis 1969
Paracoccus endophyticus Zhang et al. 2019
Paracoccus everestensis Cui et al. 2022
Paracoccus fistulariae Kim et al. 2010
Paracoccus fontiphilus Sheu et al. 2018
Paracoccus haematequi Kämpfer et al. 2019
Paracoccus haeundaensis Lee et al. 2004
Paracoccus halophilus Liu et al. 2008
Paracoccus halotolerans Meng et al. 2019
Paracoccus hibisci Yan et al. 2017
Paracoccus hibiscisoli Lin et al. 2017
Paracoccus homiensis Kim et al. 2006
Paracoccus huijuniae Sun et al. 2013
Paracoccus isoporae Chen et al. 2011
Paracoccus kocurii Ohara et al. 1990
Paracoccus kondratievae Doronina & Trotsenko 2001
Paracoccus koreensis La et al. 2005
Paracoccus laeviglucosivorans Nakamura 2015
Paracoccus liaowanqingii Li et al. 2020
Paracoccus lichenicola Lang et al. 2023
Paracoccus limosus Lee & Lee 2013
Paracoccus litorisediminis Park et al. 2017
Paracoccus luteus Ming et al. 2020
Paracoccus lutimaris Jung et al. 2014
Paracoccus mangrovi Chen et al. 2017
Paracoccus marcusii Harker et al. 1998
Paracoccus marinaquae Xue et al. 2023
Paracoccus marinus Khan et al. 2008
Paracoccus methylovorus Timsy et al. 2022
Paracoccus methylutens Doronina et al. 1998
Paracoccus niistensis Dastager et al. 2012
Paracoccus nototheniae Kämpfer et al. 2019
Paracoccus onchidii Xu et al. 2024
Paracoccus onubensis Gutierrez-Patricio et al. 2021
Paracoccus pacificus Zhang et al. 2015
Paracoccus panacisoli Nguyen et al. 2015
Paracoccus pantotrophus (Robertson & Kuenen 1984) Rainey et al. 1999
Paracoccus rhizosphaerae Kämpfer et al. 2012
Paracoccus salipaludis Dong et al. 2018
Paracoccus saliphilus Wang et al. 2009
Paracoccus salsus Gao et al. 2022
Paracoccus sanguinis McGinnis et al. 2015
Paracoccus sediminicola Zhang et al. 2023
Paracoccus sediminilitoris Wei et al. 2019
Paracoccus sediminis Pan et al. 2014
Paracoccus seriniphilus Pukall et al. 2003
Paracoccus shanxieyensis Dong et al. 2023
Paracoccus simplex Doronina et al. 2020
Paracoccus solventivorans Siller et al. 1996
Paracoccus sordidisoli Singh et al. 2017
Paracoccus sphaerophysae Deng et al. 2011
Paracoccus stylophorae Sheu et al. 2011
Paracoccus subflavus Zhang et al. 2019
Paracoccus sulfuroxidans Liu et al. 2006
Paracoccus suum Heo et al. 2019
Paracoccus tegillarcae Lee et al. 2019
Paracoccus thiocyanatus Katayama et al. 1996
Paracoccus tibetensis Zhu et al. 2013
Paracoccus versutus (Harrison 1983) Katayama et al. 1996
Paracoccus xiamenensis Lyu et al. 2020
Paracoccus yeei corrig. Daneshvar et al. 2003, parfois publiée de manière erronée sous Paracoccus yeeii.
Paracoccus zeaxanthinifaciens Berry et al. 2003

Espèces non valides

Selon la LPSN (20 juillet 2024)^[3], on retrouve plusieurs espèces publiées de manière non valide et au nom préféré (mais non correct) :

"Paracoccus aquimaris" Kim et Lee 2015
"Paracoccus beibuensis" Zheng et al. 2011
"Paracoccus benzoatiresistens" Mu et al. 2024
"Paracoccus binzhouensis" Wang et al. 2021
"Paracoccus bogoriensis" Osanjo et al. 2009
"Paracoccus ferrooxidans" Kumaraswamy et al. 2006
"Paracoccus gahaiensis" Zhang et al. 2016
"Paracoccus indicus" Lin et al. 2019
"Paracoccus jeotgali" Kim et al. 2019
"Paracoccus maritimus" Yu et al. 2024
"Paracoccus mutanolyticus" Buddana et al. 2016
"Paracoccus oceanense" Fu et al. 2011
"Paracoccus pueri" Wang et al. 2018
"Paracoccus ravus" Yoon et al. 2019
"Paracoccus schoinia" Takaichi et al. 2006
"Paracoccus shandongensis" Gong et al. 2021
"Paracoccus siganidrum" Liu et al. 2013
"Paracoccus thiophilus" Doronina et al. 2002
"Paracoccus zhejiangensis" Wu et al. 2013

Espèces synonymes

Selon la LPSN (20 juillet 2024)^[3], deux espèces ont été synonymisées et déplacées dans d'autres genres bactériens, Halomonas et Methylarcula :

"Paracoccus halodenitrificans"(Robinson et Gibbons 1952) Davis 1969 désormais renommée Halomonas halodenitrificans
"Paracoccus methylarcula"Doronina 2023 désormais renommée Methylarcula marina Doronina et al. 2000

Références

↑ Davis et et al. 1969, p. 376.
↑ ^{a b c et d} Davis et et al. 1969, p. 384.
↑ ^{a b c d e f et g} List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 20 juillet 2024

Bibliographie

Publication originale (en) Diana H. Davis, Michael Doudoroff, Roger Y. Stanier et Manley Mandel, « Proposal to reject the genus Hydrogenomonas: taxonomic implications. », International Journal of Systematic Bacteriology, vol. 19, n^o 4,‎ 1^er octobre 1969, p. 375-390 (DOI 10.1099/00207713-19-4-375)

Liens externes

Sur les autres projets Wikimedia :

Catégorie Paracoccus, sur Wikimedia Commons
Paracoccus, sur Wikispecies

(en) Myers, P. et al., Animal Diversity Web : Paracoccus, 2024 (consulté le 20 juillet 2024)
(en) Référence BioLib : Paracoccus Davis, 1969 (consulté le 20 juillet 2024)
(en) Référence Catalogue of Life : Paracoccus (consulté le 20 juillet 2024)
(fr + en) Référence GBIF : Paracoccus Ezzat & McConnell, 1956 (consulté le 20 juillet 2024)
(fr) Référence INPN : Paracoccus Davis, 1969 (TAXREF) (consulté le 20 juillet 2024)
(fr + en) Référence ITIS : Paracoccus Davis, 1969 emend. Liu et al., 2008 (consulté le 20 juillet 2024)
(en) Référence LPSN : Paracoccus Davis 1969 (consulté le 20 juillet 2024)
(en) Référence NCBI : Paracoccus (taxons inclus) (consulté le 20 juillet 2024)
(en) Référence OEPP : Paracoccus (consulté le 20 juillet 2024)
(en) Référence Taxonomicon : Paracoccus Davis 1969 (Approved Lists 1980) (consulté le 20 juillet 2024)
(en) Référence WoRMS : Paracoccus Davis, 1969 (+ liste espèces) (consulté le 20 juillet 2024)