Oryza

Oryza

Oryza sativa (riz cultivé)

Classification APG III (2009)

Règne	Plantae
Clade	Angiospermes
Clade	Monocotylédones
Clade	Commelinidées
Ordre	Poales
Famille	Poaceae
Sous-famille	Oryzoideae
Tribu	Oryzeae
Sous-tribu	Oryzinae

Genre

Oryza
L., 1753^[1]

Oryza est un genre de plantes monocotylédones de la famille des Poaceae, sous-famille des Oryzoideae^[2],[3]. Ce genre comprend une vingtaine d'espèces acceptées, dont les deux espèces de riz cultivé, Oryza sativa et Oryza glaberrima, qui figurent parmi les principales plantes alimentaires.

Les espèces du genre Oryza sont des graminées poussant dans les zones humides, qui peuvent atteindre 1 à 2 mètres de haut. Le genre comprend des espèces annuelles et vivaces^[4].

Plusieurs espèces de riz sauvage (non cultivées), notamment Oryza perennis, Oryza nivara, Oryza rufipogon, Oryza latifolia, Oryza punctata, très proches biologiquement des riz cultivés, se comportent parfois dans les rizières comme des mauvaises herbes difficiles à extirper et sont considérées comme nuisibles^[5].

Étymologie

Le mot oryza est une déclinaison (notamment le nominatif singulier^[a]) d'un nom latin féminin signifiant « riz ». Ce nom est une transcription du mot grec ὄρυζα / oryza (de même sens), lui-même issu du sanskrit via le persan.

Caractéristiques générales

Les espèces du genre oryza regroupent des plantes herbacées, annuelles ou vivaces, poussant en touffes. Les tiges (chaumes) sont dressées ou ascendantes. Les feuilles, principalement caulinaires, ont un limbe linéaire, plat, relativement large, et une ligule membraneuse^[6].

L'inflorescence est une panicule rameuse, souvent penchée, généralement composée de multiples rameaux spiciformes, les ramifications inférieures habituellement verticillées, faiblement ou non ramifiées. Les épillets, portés par un pédicelle court, sont fortement comprimés latéralement. Ils se désarticulent à maturité sous les lemmes stériles, et sont persistants chez les variétés cultivées. Ils comptent trois fleurons, dont seul le fleuron supérieur est fertile. Les fleurons stériles se réduisent à deux lemmes étroites à la base du fleuron fertile. Les glumes, à l'état de vestiges, subsistent après la désarticulation comme une collerette lobée, peu profonde, à l'apex du pédicelle. Toutefois, les écailles étroites situées à la base du fleuron fertile sont parfois considérées comme des glumes plutôt que des lemmes stériles, et la collerette à l'apex du pédicelle tout simplement comme un tissu de ce dernier. La lemme fertile carénée, scarieuse, étroitement papillée, parfois couverte de fines épines, rarement lisse, présente cinq nervures très visibles et un apex non aristé ou portant une arête droite. La paléole, semblable à la lemme, mais plus étroite, présente trois nervures et un apex se terminant en bec. Les fleurons fertiles présentent six étamines. Le fruit est un caryopse de forme variable, avec un embryon dont la longueur est 25 % de celle du caryopse, et un hile linéaire aussi long que le caryopse^[6].

Taxinomie

Synonymes

Selon GRIN (5 mars 2015)^[7] :

• Padia Moritzi ;
• Porteresia Tateoka.

Liste d'espèces

Plus de 300 noms ont été proposés comme espèces, sous-espèces et autres taxons infraspécifiques au sein du genre Oryza. Le nombre d'espèces distinctes acceptées varie selon les auteurs. Selon Kew World Checklist, seules les 19 espèces listées ci-dessous doivent être retenues comme distinctes^[8].

Selon World Checklist of Selected Plant Families (WCSP) (22 avril 2017)^[9] :

• Oryza australiensis Domin (1915)
• Oryza barthii A.Chev. (1910)
• Oryza brachyantha A.Chev. & Roehr. (1914)
• Oryza coarctata Roxb., Fl. Ind. ed. 1832 (1832)
• Oryza eichingeri Peter (1930)
• Oryza glaberrima Steud. (1853)
• Oryza grandiglumis (Döll) Prodoehl (1922)
• Oryza latifolia Desv. (1813)
• Oryza longiglumis Jansen (1953)
• Oryza longistaminata A.Chev. & Roehr. (1914)
• Oryza meyeriana (Zoll. & Moritzi) Baill. (1894)
• Oryza minuta J.Presl (1830)
• Oryza neocaledonica Morat, Bull. Mus. Natl. Hist. Nat., B (1994)
• Oryza officinalis Wall. ex Watt (1891)
• Oryza punctata Kotschy ex Steud. (1853)
• Oryza ridleyi Hook.f. (1896)
• Oryza rufipogon Griff. (1851)
• Oryza sativa L. (1753)
• Oryza schlechteri Pilg. (1914)

Génome

On a déterminé chez les espèces du genre Oryza dix types de génomes (parfois 11), dont six génomes diploïdes (AA, BB, CC, EE, FF et GG) et quatre ou cinq génomes allotétraploïdes (BBCC, CCDD, HHKK, HHJJ^[10] et KKLL^[11]. La répartition des espèces entre ces différents types de génomes est présentée ci-après^[12]. La plupart des espèces du genre Oryza ont été groupées en complexes d'espèces, en nombre variable selon les auteurs. La section Oryza sativa se subdivise en deux complexes, le complexe Oryza sativa, qui comprend sept espèces morphologiques partageant toutes le génome diploïde AA, et le complexe Oryza officinalis, qui regroupe des espèces ayant quatre génomes différents, BB, CC, DD et EE, avec à la fois des espèces diploïdes et des espèces tétraploïdes^[13].

Complexe d'espèces	Type de génome	Nombre de chromosomes (2n)	Espèces	Distribution[14]	Caractères utiles[15]	Commentaires[16]
Section Sativa
Complexe Oryza sativa	AA	24	Oryza sativa	cosmopolite	cultigène, rendement élevé
	AA	24	Oryza glaberrima	Afrique occidentale	cultigène ; tolérance à la sécheresse, à l'acidité du sol, à la toxicité ferreuse, à la carence en phosphore ; résistance à la nielle bactérienne (Xanthomonas oryzae pv oryzae), à la pyriculariose (Magnaporthe grisea), au virus de la marbrure jaune du riz (RYMV), à la cécidomyie du riz (Orseolia oryzivora), aux nématodes ; compétitivité vis-à-vis des adventices
	AA	24	Oryza barthii (Oryza breviligulata)	Afrique	résistance à la cicadelle verte, à la nielle bactérienne ; évitement de la sécheresse ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse
	AA	24	Oryza glumipatula	Amérique centrale et Amérique du Sud	aptitude à l'élongation ; source de stérilité mâle cytoplasmique (CMS) ; tolérance à la chaleur
	AA	24	Oryza longistaminata	Afrique	résistance à la nielle bactérienne, aux nématodes, aux foreurs des tiges ; évitement de la sécheresse
	AA	24	Oryza meridionalis	Australie	aptitude à l'élongation ; évitement de la sécheresse ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse
	AA	24	Oryza nivara	Asie tropicale et subtropicale	résistance au virus du rabougrissement herbacé du riz (RGSV), à la nielle bactérienne	écotype annuel d'Oryza rufipogon
	AA	24	Oryza rufipogon	Asie tropicale et subtropicale, Australie tropicale	résistance à la nielle bactérienne, à la pyriculariose, à la cicadelle brune, au virus du tungro ; tolérance modérée à la pourriture de la gaine (Thanatephorus cucumeris, anamorphe : Rhizoctonia solani) ; tolérance à l'aluminium et à l'acidité du sol ; élongation accrue sous hautes eaux ; loci d'augmentation du rendement
Complexe Oryza officinalis	BB, BBCC	24, 48	Oryza punctata	Afrique	résistance à la cicadelle brune, à la nielle bactérienne, à la cicadelle zigzag (Recilia dorsalis) ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse
	CC	24	Oryza officinalis	Asie tropicale et subtropicale, Australie tropicale	résistance aux thrips, à la cicadelle brune, à la cicadelle verte, à la pourriture des tiges (Magnaporthe salvinii) ; tolérance à la chaleur
	CC	24	Oryza rhizomatis	Sri Lanka	évitement de la sécheresse ; résistance à la pyriculariose ; tolérance à la chaleur
	CCDD	48	Oryza malampuzhaensis	Inde		race tétraploïde d'Oryza officinalis
	BBCC	48	Oryza minuta	Philippines, Papouasie Nouvelle-Guinée	résistance à la nielle bactérienne, à la pyriculariose, à la cicadelle brune, à la cicadelle verte
	BBCC	48	Oryza schweinfurthiana	Afrique		race tétraploïde d'Oryza punctata
	BBCC	48	Oryza eichingeri	Afrique orientale, Sri Lanka	résistance à la cicadelle brune (Nilaparvata lugens), à la cicadelle à dos blanc (Sogatella furcifera), à la cicadelle verte	seule espèce présente à la fois en Asie et en Afrique
	CCDD	48	Oryza alta	Amérique centrale et Amérique du Sud	résistance à la pyrale rayée du riz (Chilo suppressalis) ; production élevée de biomasse
	CCDD	48	Oryza grandiglumis	Amérique du Sud	production de biomasse élevée
	CCDD	48	Oryza latifolia	Amérique centrale et Amérique du Sud	résistance à la cicadelle brune, à la nielle bactérienne ; production élevée de biomasse
Section Australiensis
	EE	24	Oryza australiensis	Australie tropicale	résistance à la pyriculariose, à la nielle bactérienne, à la cicadelle brune ; évitement de la sécheresse ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse	membre du complexe Oryza officinalis
Section Brachyantha
	FF	24	Oryza brachyantha	Afrique	tolérance à l'ombre ; stolonifère
Section Padia						Section basale ou primitive du genre Oryza
	HHKK	48	Oryza schlechteri	Papouasie Nouvelle-Guinée	stolonifère
	KKLL	48	Oryza coarctata	Asie du sud	tolérance au sel ; stolonifère
Section Ridleyanae
Complexe Oryza ridleyi	HHJJ	48	Oryza longiglumis	Iran Jaya, Indonésie, Papouasie Nouvelle-Guinée	résistance à la pyriculariose, à la nielle bactérienne
	HHJJ	48	Oryza ridleyi	Asie du Sud, Papouasie Nouvelle-Guinée	résistance à la pyriculariose, à la nielle bactérienne, au virus du tungro, aux foreurs des tiges et à la mineuse du riz (Hydrellia philippina)
Section Granulata
Complexe Oryza meyeriana	GG	24	Oryza granulata	Asie du Sud	tolérance à l'ombre ; adaptation aux sols aérobies	variété dOryza meyeriana
	GG	24	Oryza meyeriana	Asie du Sud-Est	tolérance à l'ombre ; adaptation aux sols aérobies
	GG	24	Oryza neocaledonica	Nouvelle-Calédonie

Phylogénie

Notes et références

Notes

1. Le génitif singulier oryzae (« du riz ») est employé comme épithète spécifique pour nommer de nombreuses espèces d'insectes ravageurs du riz et de moisissures responsables de maladies cryptogamiques. Pour les articles consacrés à de telles espèces, consulter la liste générée automatiquement.

Références

1. Tropicos.org. Missouri Botanical Garden., consulté le 5 mars 2015
2. (en) Robert J. Soreng, Paul M. Peterson, Konstantin Romaschenko, Gerrit Davidse, Fernando O. Zuloaga, Emmet J. Judziewicz, Tarciso S. Filgueiras, Jerrold I. Davis et Osvaldo Morrone, « A worldwide phylogenetic classification of the Poaceae (Gramineae) », Journal of Systematics and Evolution (JSE), vol. 53, n^o 2,‎ mars 2015, p. 117–202 (lire en ligne).
3. (en) « Oryza L. », Tropicos (consulté le 5 mars 2015).
4. (en) « 稻属 dao shu Oryza Linnaeus, Sp. Pl. 1: 333. 1753. », sur Flora of China (consulté le 5 mars 2015).
5. A. Ferrero, « Le riz nuisible, caractères biologiques et contrôle », dans R. Labrada, Gestion des mauvaises herbes pour les pays en développement: Addendum 1, Rome, FAO, 2005 (lire en ligne), p. 92-114.
6. (en) « 37. Oryza Linnaeus, Sp. Pl. 1: 333. 1753. », sur Flora of China (eFloras.org) (consulté le 3 mai 2017).
7. USDA, Agricultural Research Service, National Plant Germplasm System. Germplasm Resources Information Network (GRIN-Taxonomy). National Germplasm Resources Laboratory, Beltsville, Maryland., consulté le 5 mars 2015
8. (en) « Oryza L., Sp. Pl.: 333 (1753). », sur World Checklist of Selected Plant Families (WCSP), Royal Botanic Gardens, Kew (consulté le 22 avril 2017).
9. WCSP. World Checklist of Selected Plant Families. Facilitated by the Royal Botanic Gardens, Kew. Published on the Internet ; http://wcsp.science.kew.org/, consulté le 22 avril 2017
10. (en) Fei Lu et al., « Comparative sequence analysis of MONOCULM1-orthologous regions in 14 Oryza genomes », National Academy of Sciences of the USA, 2009 (consulté le 22 avril 2017).
11. (en) J. Maclean, B. Hardy, G. Hettel, Rice Almanac : Source Book for One of the Most Important Economic Activities on Earth, IRRI, 2013, 4^e éd., 283 p. (ISBN 978-971-22-0300-8, lire en ligne), p. 7-10.
12. (en) Song Ge, Tao Sang, Bao-Rong Lu et De-Yuan Hong, « Evolution Phylogeny of rice genomes with emphasis on origins of allotetraploid species », Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), vol. 96, n^o 25,‎ 7 décembre 1999, p. 14400–14405 (PMCID PMC24448, lire en ligne).
13. (en) Jonathan Gressel, Crop Ferality and Volunteerism, CRC Press, 2005, 448 p. (ISBN 978-1-4200-3799-9, lire en ligne), p. 258-259.
14. (en) Hiro-Yuki Hirano, Atshushi Hirai, Yoshio Sano, Takuji Sasaki, Rice Biology in the Genomics Era, volume 62 de Biotechnology in Agriculture and Forestry, Berlin, Springer Science & Business Media, 2008, 381 p. (ISBN 978-3-540-74250-0, lire en ligne), p. 239-240.
15. (en) Paul L. Sanchez, Rod A. Wing, et Darshan S. Brar, « The Wild Relative of Rice: Genomes and Genomics », dans Qifa Zhang, Rod A. Wing, Genetics and Genomics of Rice, volume 5 de Plant Genetics and Genomics: Crops and Models, Springer Science & Business Media, 2013, 402 p. (ISBN 9781461479031, lire en ligne), p. 9-24.
16. (en) Jay Maclean, Bill Hardy et Gene Hettel, Rice Almanac, 4^e édition, Institut international de recherche sur le riz (IRRI), 2013, 298 p. (ISBN 978-971-22-0300-8, lire en ligne).

Voir aussi

Liens externes

• (en) Référence Catalogue of Life : Oryza L. (consulté le 30 mars 2023)
• (en) Référence Flora of China : Oryza (consulté le 5 mars 2015)
• (en) Référence Madagascar Catalogue : Oryza (consulté le 5 mars 2015)
• (en) Référence Flora of Pakistan : Oryza (consulté le 5 mars 2015)
• (en) Référence FloraBase (Australie-Occidentale) : classification Oryza (+ photos + répartition + description) (consulté le 5 mars 2015)
• (en) Référence GRIN : genre Oryza L. (+liste d'espèces contenant des synonymes) (consulté le 5 mars 2015)
• (fr + en) Référence ITIS : Oryza L. (consulté le 5 mars 2015)
• (en) Référence World Checklist of Selected Plant Families (WCSP) : Oryza L. (1753) (consulté le 5 mars 2015)
• (en) Référence NCBI : Oryza (taxons inclus) (consulté le 5 mars 2015)
• (en) Référence The Plant List : Oryza (consulté le 5 mars 2015)
• (en) Référence Tropicos : Oryza L. (Syn. Leersia Sw.) (+ liste sous-taxons) (consulté le 5 mars 2015)
• (en) Référence UICN : taxon Oryza (consulté le 5 janvier 2023)