Il travaille en particulier sur la taxinomie difficile du genre Festuca pour lequel il propose un certain nombre d'espèces nouvelles.
Il publie en 1993 l'Index synonymique de la flore de France qui deviendra accessible sur Internet en 1998. Après son décès en 1999, son actualisation est assurée par Benoit Bock. Plus tard le Muséum national d'histoire naturelle de Paris s'impliquera officiellement en déléguant ce travail à l'association Tela Botanica pour laquelle Benoit Bock continuera d'oeuvrer.
Œuvres
Les Graminaceae (Poaceae) de la flore française. Essai de mise au point taxonomique et nomenclaturale Lejeunia nouvelle série, t 75, 1975, p. 1-343
Bibliographie
Benoît Dayrat, Les Botanistes et la Flore de France. : Trois siècles de découvertes, Paris, Publications scientifiques du Muséum national d'histoire naturelle, coll. « Archives », , 690 p. (ISBN2856535488 et 978-2856535486)
A la mémoire de Michel Kerguélen ( - ), par Gérard-Guy Aymonin, in ERICA 13 : 99-100