Louise Leakey est née à Nairobi, au Kenya, en Afrique, en 1972, l'année du décès de son grand-père Louis Leakey. Passionnée de préhistoire depuis ses 6 ans, elle se lance définitivement comme paléontologue en 1977.
En 1993, Louise Leakey a remplacé son père Richard en tant que chef d'expédition sur le terrain pour les expéditions paléontologiques au Turkana, dans un environnement aride et hostile. Avec sa mère, Maeve, elle a dirigé le projet de recherche « Koobi Fora », qui a été le programme principal derrière certaines des plus remarquables découvertes de fossiles d'hominidés des deux dernières décennies, les plus récentes découvertes étant le Kenyanthropus platyops.