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La deuxième maison de Bragance est celle de la lignée des ducs de Bragance (Bragança en portugais). Elle trouve son origine chez le roiJean Ier de Portugal (1357-1433), fondateur de la maison d'Aviz (issue de la première maison capétienne de Bourgogne), dit le Roi de Bonne Mémoire, qui avait eu, dix ans avant son mariage en 1387 avec Philippa d'Angleterre, une relation suivie avec Inês Pires, dont sont issus au moins trois enfants.
Pour l'aîné de ces enfants, et le seul garçon, déjà créé comte de Barcelos lors de son mariage, la ville de Bragance fut érigée en duché en 1442, à l'initiative de son frère consanguin l'infant Pierre de Portugal (1392-1449), dit le prince des Sept Parties du Monde, régent de Portugal au nom de son neveu et beau-fils Alphonse V. Les biens immenses de cette nouvelle maison sont venus par le mariage du premier duc avec la seule fille et héritière de Dom Nuno Álvares Pereira, comte de Barcelos, dit le Saint Connétable, le vainqueur de la dynastie antérieure à Aljubarrota (béatifié plus tard par Rome, il est aussi la souche des ducs de Cadaval, issus des Bragance eux aussi, et qui portent toujours son nom). Le duché de Bragance est l'un des premiers duchés portugais, titre réservé au Portugal jusqu'au XIXe siècle aux mâles de lignée royale. Seuls les duchés de Coimbra, de l'infant Pierre de Portugal, et de Viseu, de leur frère l'Infant Henri, le Navigateur, sont plus anciens. Tous sont des titres exclusifs de la maison royale du Portugal.
1478-1483 : Ferdinand II de Bragance (1430-1483), comte puis premier duc de Guimarães Fils du duc Ferdinand Ier et de Jeanne de Castro (morte en 1479), dame de Cadaval, d'une branche cadette de la Maison de Castro 3e duc de Bragance (1478-1483). Ayant comploté avec ses cousins les Rois catholiques d'Aragon et de Castille contre le roi Jean II de Portugal (1455-1495), il fut décapité, et exproprié de tous ses biens, rendus à la Couronne. Son fils puîné fut Denis, mari de Béatrice de Castro, comtesse de Lemos, de la branche aînée de la maison de Castro < Isabelle ci-dessous, qui épousa son cousin germain Théodose Ier
1483-1532 : Jacques Ier de Bragance (1479-1532), deuxième duc de Guimarães Fils du duc Ferdinand II et de sa deuxième femme Isabelle de Portugal-Viseu (1459-1521) 4e duc de Bragance (1483-1532). Il a été reconnu héritier de Portugal sous son oncle le roi Emmanuel Ier le Fortuné, lui-même arrière-petit-fils d'Alphonse Ier de Bragance ci-dessus par sa mère Béatrice fille d'Isabelle et du connétable Jean de Portugal ci-dessus, qui le fait revenir d'exil et le rétablit dans tous les biens, titres et prérogatives de ses pères
1532-1563 : Théodose Ier de Bragance(pt) (av. 1512-1563), troisième duc de Guimarães Fils du duc Jacques Ier et de sa première femme Éléonore (Louise ?) Pérez de Guzman (morte en 1512 ; des ducs de Medina Sidonia ; mais certains disent : fils de la deuxième femme de Jacques, Éléonore ou Jeanne de Mendoza) 5e duc de Bragance (1532-1563) ; sa sœur Isabelle épouse l'infant Duarte/Édouard, quatrième duc de Guimarães, fils puîné du roi Manuel
Depuis Jean IV, le titre et les immenses revenus du duché de Bragance furent donnés à tous les princes héritiers de la quatrième dynastie portugaise, qui ne le portaient pas toutefois, étant connus comme prince du Brésil (successeur immédiat) et prince da Beira (l'héritier du successeur). En 1831, l'ex-roi de Portugal et ex-empereur du Brésil, Pierre IV et Ier, après avoir abdiqué les deux couronnes, décida de le porter, ce qu'il fit comme régent de Portugal jusqu'à sa mort en 1834, à la fin de la guerre civile portugaise. De son côté, son frère cadet le roi déchu Michel Ier, le conféra en exil à son fils Michel de Bragance (1853-1927). Le titre, désormais de courtoisie, de duc de Bragance est actuellement porté par le chef de la deuxième branche de la maison de Bragance (la branche aînée étant américaine), qui est un des prétendants au trône et dont l'immédiat successeur porte celui de prince de Beyre : il devrait se revendiquer à son tour duc de Bragance à la mort de son père. Le titre continue actuellement à être contesté par les descendants de Michel Janvier de Bragance et par les descendants de Maria Pia de Saxe-Cobourg Bragance et identifie donc aujourd'hui un de ceux qui pourrait régner au Portugal si la monarchie était rétablie.[Quoi ?]
