Alors qu'il s’apprête à se marier avec Giselle, Elliot se rend brusquement compte que Monsieur Saucisse est enlevé par ses propriétaires Bob et Bobby, qui le ramènent auprès d'un groupe d'animaux domestiques, dirigé par le caniche Fifi, qui voue une haine féroce envers les bêtes sauvages. Boog, Elliot et tous les autres rebelles se lancent dans une grande mission de sauvetage pour lui venir en aide. C'est le début d'une guerre entre les animaux sauvages et les animaux domestiques.
