Sorti en 60e position de Saint-Cyr en 1897, il sert d'abord dans les chasseurs alpins. Il est promu successivement lieutenant en , capitaine en , chef de bataillon en , lieutenant-colonel en 1917[1], colonel en 1922 et général de brigade en . Il est général de division en 1931[2].
Promu général de division en 1931[2], il reçoit en 1932 le commandement de la 5e division d'infanterie[3]. En , il prend à Rouen le commandement de la 3e région militaire. Il commémore, en novembre 1935, le « sacrifice [...] commandé et consenti, presque toujours obscur, des soldats [...] morts pour la patrie » et, le , consigne les troupes dans leurs casernes lors d'une manifestation du Front populaire. Ces actions stoppent son avancement et il est atteint par la limite d'âge en avril 1937[3].
C'est le général Duffour qui, le , veille de l'invasion de Rouen, fixe les modalités de défense de la Seine, en amont de la préfecture du département. Ces modalités de défense de retardement sont à l'origine, entre autres, du combat de Pont-de-l'Arche qui a lieu le lendemain[3].
Le , il se marie à Zoé Jeanne Charlotte Germaine Duffour. Ensemble, ils ont un fils, Pierre (°1906), qui optera pour la carrière militaire.
Publications
Histoire de la Guerre mondiale. Tome I, Joffre et la guerre de mouvement 1914, Payot, 1937[5] (le tome II (Joffre et la guerre d'usure 1916) est publié sous la signature du général Marius Daille.
Cours d'art militaire : Guerre de 1914-1918, conférences par le lieutenant-colonel Duffour ; École supérieure de guerre - Lithographie de l'École supérieure de guerre, 1919[6]
Cours d'histoire : La guerre de 1914-1918, par le colonel Duffour, Paris, École supérieure de guerre, 1923, impr. 1924[7]
Cours de stratégie : Deux conférences sur l'élément terrain en stratégie (complément au t. IV) par le général Duffour, Centre des hautes études militaires, 1931[8]
Le Togo et le Cameroun ont été conquis de haute lutte et payés du sang de nos soldats et non pas arrachés à l'Allemagne vaincue comme on le dit outre-Rhin - Le Mittelafrika, véritable mesure de l'appétit colonial du IIIe Reich, par le général Duffour, Paris, Centre de propagande des républicains nationaux, 1938, 4 p., articles extraits de L'Époque, et (FRBNF35261793)