Jusqu'en 2003, elle participe essentiellement à des épreuves du circuit ITF en Europe : elle y obtient de notables succès (soixante-et-un titres glanés durant sa carrière).
À partir de 2004, elle se consacre exclusivement au double dames. Son classement dans la discipline progresse, lui permettant de s'aligner dans la plupart des tournois WTA du calendrier. L'année suivante, associée à Michaela Paštiková, elle atteint les demi-finales de l'Open d'Australie, le meilleur résultat de sa carrière en Grand Chelem.
Gabriela Navrátilová a joué six finales WTA en double dames, avec quatre partenaires différentes, sans parvenir à s'imposer.
Elle a un lien de parenté avec son illustre compatriote Martina Navrátilová par son grand-père paternel.