Il est désigné le pour succéder à Claude Auvry qui se démet de son diocèse de Coutances. Le , Eustache Le Clerc de Lesseville, reçoit ses bulles de confirmation et il est consacré le 23 mars par son prédécesseur Claude Auvry. Il soutient François de La Luthumière, fondateur et supérieur du séminaire de Valognes, lors des polémiques suscitées à ce dernier, en raison de ses relations avec les théologiens de Port-Royal. Pendant son épiscopat, en 1662, son diocèse voit s'implanter une nouvelle congrégation religieuse, celle des Augustines Hospitalières à Vire.