À partir de 1982, Zangger se spécialise dans le domaine de la géoarchéologie. Parmi ses premiers objets d’étude et découvertes, on compte le site côtier néolithique de Dimini Magoula en Grèce centrale, l’extension du lac de Lerne[3], la datation exacte et le fonctionnement du détournement des rivières par les Mycéniens ainsi que la basse-ville de Tirynthe[4], le caractère insulaire d’Asinè[5], le port artificiel de Nestor près de Pylos[6] et même un mécanisme de lavage d’eau potable et un barrage artificiel sur site minoen de Monastiraki en Crète centrale.
Zangger a acquis une notoriété internationale en 1992 avec son interprétation affirmant que l’Atlantide de Platon serait en fait Troie, qu’il exposa pour la première fois dans son premier livre The Flood from Heaven[7] Platon aurait transformé sans le savoir une variante égyptienne du récit de la chute de Troie en son mythe de l’Atlantide. L’argumentation de Zangger établit un parallèle entre les indications de Platon sur la guerre opposant la Grèce et l’Atlantide et différentes sources antiques sur la guerre de Troie. Dans un article de l’Oxford Journal of Archaeology de 1993, Zangger énumère de nombreux points communs entre la description de l’Atlantide par Platon et les représentations de Troie au Bronze final[8].
En 1994, il poursuit avec un autre livre, Ein neuer Kampf um Troia[9], dans lequel il établit un lien entre les inscriptions des temples égyptiens au sujet des invasions des peuples de la mer vers 1200 av. J.-C. et la tradition sur la guerre de Troie. Dans ce livre, il présente pour la première fois une chronologie de l’évolution politique et économique dans le bassin méditerranéen oriental au cours du XIIIe siècle av. J.-C., selon sa perspective. Il interprète la légende de la guerre de Troie comme le souvenir d’une « guerre mondiale » au cours de laquelle les nations du bassin méditerranéen oriental se sont en grande partie effondrées vers 1200 av. J.-C. Dans sa thèse, Zangger donne une importance plus grande aux nations de l’Anatolie de l’Ouest et du Nord-Ouest – les petits royaumes louvites mentionnés dans les documents hittites tels que Arzawa, Mira[Où ?], Wilusa, Lukka et le Pays de la rivière Seha – que ce qui se pensait alors communément. Selon lui, si ces petits pays s’étaient unis, ils auraient égalé l’importance militaire et économique de la Grèce mycénienne ou de la Crète minoenne. Ils s’opposaient au royaume hittite et réapparaissent en tant que «peuples de la mer» dans les sources égyptiennes du temps de Mérenptah et Ramsès III. Cette coalition était formée par l’Assyrie, les Gasgas et les tribus libyennes. Les Hittites comptaient (outre les royaumes vassaux d’Amurru et Ougarit) l’Égypte et la Grèce mycénienne comme alliés[10].
En 1998, dans son troisième livre, Die Zukunft der Vergangenheit[11], Zangger esquisse l’évolution des événements au cours du XIIe siècle av. J.-C., après la guerre de Troie. Des groupes dispersés de survivants des invasions des peuples de la mer et de la guerre de Troie fondèrent de nouvelles colonies en Italie et en Syrie/Palestine, et participèrent ainsi à la naissance des cultures étrusques et phéniciennes, selon la théorie de Zangger. Il argumente par ailleurs que l’éruption de Santorin au XVIIe siècle av. J.-C. n’a pas pu donner lieu à l’effondrement de la caldeira, et donc à aucun tsunami. Pour Zangger, le rôle des catastrophes naturelles dans les bouleversements culturels a été surévalué. Il plaide au contraire pour une plus grande implication des sciences naturelles et une participation accrue des spécialistes en urbanisme et génie hydraulique dans l’archéologie.
En 1998, en collaboration avec l’Institut fédéral des géosciences et des ressources naturelles allemand (BGR) de Hanovre, Zangger prépare également un projet d’exploration par hélicoptère de la plaine de Troade pour y localiser des structures urbaines et des bassins portuaires artificiels à l’aide de mesures géomagnétiques[12] Mais le ministère turc de la culture n’a pas autorisé le projet[13].
Zangger annonce en avril 2001 lors d’une conférence devant l’Académie des sciences de Heidelberg qu’il abandonne la recherche pour un certain temps[14],[15] En 1999, il devient consultant en relations publiques dans une agence de communication établie à Zurich[16].En 2002, il travaille comme indépendant et fonde le cabinet de conseil pour la communication d’entreprise science communications GmbH à Zurich.
Depuis avril 2014, Zangger est président du conseil de la fondation internationale à but non lucratif Luwian Studies. Le but de la fondation, tel qu’il apparaît dans le registre du commerce du canton de Zurich, est « la recherche sur le deuxième millénaire avant Jésus-Christ en Asie Mineure occidentale ainsi que la diffusion des connaissances à ce sujet »[17].
Le magazine « Der Spiegel » a consacré aux projets et publications de Zangger sept articles de plusieurs pages entre 1992 et 1999, dont un article de couverture, et l’a qualifié à différentes reprises d’« Einstein de l’Antiquité »[12].
Publications
The Landscape Evolution of the Argive Plain (Greece). Paleo-Ecology, Holocene Depositional History and Coastline Changes. Thèse de doctorat à l'Université Stanford , University Microfilm International, Ann Arbor, Michigan 1988.
Prehistoric Coastal Environments in Greece: The Vanished Landscapes of Dimini Bay and Lake Lerna. Journal of Field Archaeology 18 (1): 1-15. 1991.
The Flood from Heaven – Deciphering the Atlantis Legend. Sidgwick & Jackson, Londres 1992 (ISBN0-283-06084 0).
The Geoarchaeology of the Argolid. (Édité par l’Institut archéologique allemand à Athènes), Mann, Berlin 1993 (ISBN3-7861-1700-4).
Plato’s Atlantis Account: A distorted recollection of the Trojan War. Oxford Journal of Archaeology 18 (1): 77-87. 1993.
The Island of Asine: A paleogeographic reconstruction. Opuscula Atheniensa XX.15: 221-239. 1994.
Ein neuer Kampf um Troia. Archäologie in der Krise. Droemer Knaur, Munich 1994 (ISBN3-426-26682-2).
En collaboration avec Michael Timpson, Sergei Yazvenko, Falko Kuhnke y Jost Knauss: The Pylos Regional Archaeological Project; Landscape Evolution and Site Preservation. Hesperia 66 (4): 549-641. 1997.
Das Atlantis=Troja-Konzept – Auf den Spuren einer versunkenen Kultur in Westkleinasien. Vierteljahresschrift der Naturforschenden Gesellschaft in Zürich 143 (1), 13-23. 1998.
Die Zukunft der Vergangenheit. Archäologie im 21. Jahrhundert. Schneekluth, Munich 1998 (ISBN3-7951-1652-X).
En collaboration avec Michael Timpson, Sergei Yazvenko y Horst Leiermann: Searching for the Ports of Troy. Dans: Philippe Leveau, Frédéric Trément, Walsh Kevin, Barker Graeme (éd.) Environmental Reconstruction in Mediterranean Landscape. Oxford 1999 (ISBN978-1-900188-63-0).
Some Open Questions About the Plain of Troia. Dans: Troia and the Troad – Scientific Approaches. Springer, Berlín, 317-324. 2003 (ISBN3-540-43711-8).
Die End-Zeit der Diven Dans: Schwäbisches Tagblatt. 18 février 2002, à l’occasion de la conférence sur Troie de Tübingen (version du 9 novembre 2003 sur Internet Archive; archivé).