En 1573, La Châtre est chargé de reprendre Sancerre, qui capitule par grande famine après sept mois de siège. Il négocie la capitulation de la ville forte avec les chefs protestants, dont Jean de Léry, pasteur auteur du Voyage fait en la terre du Brésil.
En 1575, il est envoyé à Londres en tant qu'ambassadeur extraordinaire afin de conforter l'entente entre la France et l'Angleterre. Il rejoint par la suite le parti des Malcontents, combat aux côtés du duc d'Alençon, puis l'accompagne dans son expédition aux Pays-Bas en tant que commandant de sa cavalerie légère.
À la mort du duc d'Alençon en 1584, La Châtre se rapproche du duc de Guise et rallie la Ligue en 1585. Le 21 décembre 1585, il est reçu dans l'Ordre du Saint-Esprit. Durant l'automne 1587, il se distingue au cours de la campagne contre les reîtres, participant notamment au combat d'Auneau. En 1588, La Châtre est destitué par Henri III de sa charge de gouverneur du Berry. Après l'assassinat du roi, il refuse d’abord de reconnaître Henri IV et se saisit du Berry pour le parti de la Ligue[3], tout en faisant partie de l'état-major de l'armée ligueuse commandée par le duc de Parme. En 1593, il est fait maréchal de France par le duc de Mayenne. Il fait finalement sa soumission en 1594, remet au roi les villes d’Orléans et de Bourges, en récompense de quoi il est confirmé dans ses charges de maréchal de France et de gouverneur d'Orléans et de Bourges.
Après la mort d’Henri IV, Louis XIII le fait lieutenant général de l’armée qu’il envoie au siège de Juliers en 1610. Son action contraint l’évêque de Strasbourg à remettre cette ville aux mains de l’Électeur de Brandebourg. En récompense, il tient la fonction de connétable de France au sacre de Louis XIII le 17 octobre 1610, le duc de Montmorency (Henri ci-dessus, † en avril 1614), âgé et malade, ne pouvant se rendre à Reims.
Écartelé : aux 1 et 4, de gueules, à la croix ancrée de vair (de La Châtre) ; aux 2 et 3, de gueules, à trois têtes de loup d'argent (Saint-Amadour).[5]
↑Nicolas Le Roux, « L'exercice de la fidélité entre loyauté et rébellion : le parcours politique du maréchal de la Ligue Claude de La Châtre », Revue d'histoire moderne et contemporaine, 1996, p. 195-213.
Nicolas Le Roux : L'exercice de la fidélité entre loyauté et rébellion : le parcours politique du maréchal de la Ligue Claude de La Châtre, In : Revue d’histoire moderne et contemporaine, tome 43 N°2, Avril-juin 1996. pp. 195-213, (voir en ligne).