La CCI est un organisme chargé de représenter les intérêts des entreprises commerciales, industrielles et de service du Doubs et de leur apporter certains services. C'est un établissement public qui gère en outre des équipements au profit de ces entreprises.
Comme toutes les CCI, elle est placée sous la tutelle du préfet du département représentant le ministère chargé de l'industrie et le ministère chargé des PME, du Commerce et de l'Artisanat.
La CCI est administrée par des dirigeants d'entreprises élus, dont le nombre, par catégories professionnelles, est fixé par arrêté préfectoral.
Le Bureau est élu par l’Assemblée Générale. Organe consultatif auprès du président, le Bureau est une instance de débat collégial. C'est là que sont étudiées les grandes orientations de l’action de la CCI du Doubs, qui sont ensuite soumises à l’approbation de l’assemblée générale.
