Après plusieurs supplications d'Ahmed Sékou Touré, Balla rejoint la Guinée pour participer à la construction du nouveau pays. Il fut nommé : inspecteur général des Affaires administratives et financières, secrétaire général du gouvernement, secrétaire d'État à la Justice, au contrôle administratif et financier, ministre des Finances et de l'Administration, ministre du Commerce intérieur, et gouverneur de la Banque centrale de la république de Guinée[3].
Selon lui, l'indépendance aurait dû se dérouler au moins dix ans plus tard. Il remarque aisément que la brusque décolonisation a fortement déstabilisé l'économie du pays, et qu'elle aura bien d'autres conséquences.
Arrestation et fin de vie
Le , à la suite d'un discours dans lequel il décrit les insuffisances du système politique d'alors, il est arrêté est condamné à cinq ans de prison pour « propos subversifs. » Il fut incarcéré au camp Boiro, puis libéré lors du débarquement portugais le (opération Mar Verde)[4]. Il fut repris seulement un jour plus tard avant d'être fusillé.
