L'académie de Besançon est une circonscription éducative française gérée par un recteur d'académie, chancelier des universités, qui regroupe l'ensemble des établissements scolaires de Franche-Comté à travers quatre inspections académiques, soit une par département : le Doubs, le Jura, la Haute-Saône et le Territoire de Belfort.
L’académie de Besançon fait partie de la zone A depuis la rentrée scolaire 2015-2016.