Ykköspesis-kausi 2003 oli Suomen pesäpallon toiseksi korkeimman sarjatason Ykköspesiksen 23. kausi. Kauteen osallistui 16 joukkuetta.
Kauden päätteeksi Superpesiskarsintojen kautta Vimpelin Veto, Joensuun Maila ja Nurmon Jymy nousivat Superpesikseen.
Runkosarja oli jaettu kahteen lohkoon, lohkojen sisällä joukkueet pelasivat kaksinkertaisen sarjan jonka lisäksi joukkueet pelasivat yhden ottelun toisen lohkon joukkueita vastaan. Molempien lohkojen voittajat etenivät suoraan Superpesiskarsintoihin. Lohkojen toiseksi ja kolmanneksi sijoittuneet joukkueet pelasivat ristiin paras-kolmesta järjestelmällä paikasta Superpesiskarsintoihin.
Molempien lohkojen viimeiseksi jääneet joukkueet putosivat suoraan Suomensarjaan seuraavaksi kaudeksi. Lohkojen sijoille 6-7 sijoittuneet joukkueet pelasivat ristiin paras-kolmesta järjestelmällä putoamisesta Suomensarjaan. [1]