Surgió a partir de columnas y cartas que escribió Warnken en la radioemisora Pauta FM y en el diario El Mercurio. Una se llamaba «Carta amarilla a mis hijos», fue publicada el 27 de noviembre de 2021, y en ella habla de un episodio que vivió en Isla Negra, cuando un grupo de jóvenes le gritó «amarillo» y «facho». Tomó el concepto «amarillo» de los años 1970, cuando se usaba para descalificar a los reformistas. El término había sido actualizado antes por Patricio Fernández, quien publicó una columna en el quincenario The Clinic, el 26 de julio de 2018.[14] Warnken publicó la columna Carta a todas las bases amarillas del país en Pauta el 5 de febrero de 2022, la que detonó en la fundación del movimiento.[15] En la carta se criticaba a la Convención Constitucional por sus, a palabras de Warnken, propuestas «refundacionales» y maximalistas;[15] a pesar de dicha crítica ni el movimiento ni el propio Warnken presentaron posteriormente iniciativas y propuestas a la Convención.[16] En un principio el movimiento empezó a articularse y moldearse a través de un grupo de la red de mensajería WhatsApp.[15] De igual forma, se estableció a Warnken como vocero del movimiento.[15]
En febrero de 2022 el líder y fundador del colectivo, Cristián Warnken, se refirió al texto que sería emanado por Convención Constitucional. En la ocasión dijo «Si es una Constitución amarilla vamos a aprobarla», sin embargo, a su juicio, estaba lejos de serlo.[17] El 25 de junio de 2022, Cristián Warnken, llamó públicamente en su calidad de vocero a votar por la opción «Rechazo» para el plebiscito constitucional de Chile de 2022, llegando a hacer campaña por dicha opción y teniendo un espacio en la franja televisiva.[18]
El 23 de septiembre de 2022 fue presentado el manifiesto fundacional de Amarillos por Chile como partido político, junto con presentar su directiva provisional,[22] esto a pesar de que inicialmente declinaron sus intenciones de transformarse en un partido propiamente tal esto al declarar sus intenciones de "mantenerse como un movimiento de estructura liviana".[15] Ese mismo día se presentaron los primeros 100 militantes, quienes principalmente eran exmilitantes y expolíticos del Partido por la Democracia y el Partido Demócrata Cristiano.[22] El 21 de octubre de 2022 el Servicio Electoral (Servel) declaró a la colectividad como "en formación".[23] El 22 de abril de 2023 el movimiento logró reunir las firmas necesarias para constituirse como partido político. Esto tras cumplir el requisito exigido en la normativa vigente para hacerlo en tres regiones contiguas (La Araucanía, Los Ríos y Los Lagos),[24] siendo acogida su inscripción el 29 de junio de 2023; dejando de ser un partido político en formación, y convirtiéndose oficialmente en un partido político.[2]
Amarillos por Chile tiene un consejero regional, quien fue electo como independiente en la lista de Evolución Política en las elecciones nacionales de 2021: