後二条天皇(日语:後二条天皇/ごにじょうてんのう Go-nijō Tennō;1285年3月9日—1308年9月10日),為日本鎌倉時代的第94代天皇(1301年3月2日—1308年9月10日在位)。諱邦治(日语:邦治/くにはる Kuniharu)。
1301年一月二十二日,因後伏見天皇的讓位而登基為天皇。
1308年八月二十五日,因急病而崩御。得年24歲。
在位期間由其父後宇多上皇實行院政。