Кшиштоф Бонковський є вихованцем познаньського футболу. Він починав грати в молодіжних командах «Варта» та «Лех».[1] Починаючи з сезону 2019/20 Бонковський був внесений до заявки першої команди. Але продовжував грати за дубль.
Починаючи з 2021 року воротар для набору ігрової практики був відправлений в оренду. Він виступав за клубу Першої ліги «Стоміл»[2] та «Сталь»[3] з міста Ряшів. Влітку перед початком сезону 2023/24 Бонковський знову відправився в оренду. Цього разу його клубом став «Радом'як», який виступає у Екстракласі.
Збірна
З 2018 року Кшиштоф Бонковський грав за юнацькі збірні Польщі різних вікових категорій. 27 вересня 2022 року у товариському матчі проти молодіжної збірної Латвії Бонковський дебютував у складі молодіжної збірної Польщі.