Від 1947 року працювала в Інституті історії АН УРСР (нині Інститут історії України НАН України). 1950 року захистила кандидатську дисертацію «Формування робітничого класу залізорудної та металургійної промисловості Півдня України у 80—90-х роках 19 століття». 1965 року захистила докторську дисертацію «Міста України в другій половині 19 століття».
Виступала з ревізією теоретичних питань історичного процесу. Брала участь у русі шістдесятників. Активно працювала в Українському товаристві охорони пам'яток історії та культури, де займала виразну громадську позицію.
Наказом по Інституту історії від 12 вересня1972 року Олену Компан звільнили з роботи («за пропаганду буржуазно-націоналістичних ідей і дружні взаємини з репресованими дисидентами», як зазначено в історії Інституту). Після цього діяла заборона на її виступи в пресі.
Померла 17 липня1986 року. Похована на Байковому кладовищі (дільниця № 20). На могилі встановлено спільний із другим чоловіком пам'ятник. Це прямокутна стела із сірого граніту, на якій два керамічні портрети овальної форми й напис: «Письменник Іван Сенченко. 1901–1975. Історик Олена Компан. 1916–1986».
Праці
«Вплив визвольної війни українського народу на розвиток антифеодального руху в Польщі» (1954).
«Участь міського населення у визвольній війні українського народу, 1648–1654 рр.» (1954).
«Єдність світового історичного процесу» (1966).
«Культурна спадщина в світлі марксистсько-ленінської теорії» (1970).
Білокінь С. Компан Олена Станіславівна // Довідник з історії України. — 2-е видання. — К., 2001. — С. 332–333.
Архів українського історика Олени Компан у фондах Інституту рукопису Національної бібліотеки України імені В.І. Вернадського : Біографічне дослідження : Науковий каталог / М. А. Філіпович, І. В. Клименко. – Київ : НБУ ім. В.І. Вернадського, 2019. – 200 с. – ISBN 966-02-8786-0.
Філософ в історії. До 100-річчя від дня народження О. Компан (1916–1986) // Дати і події, [Архівовано 30 Квітня 2016 у Wayback Machine.] 2016, перше півріччя : календар знамен. дат № 1 (7) / Нац. парлам. б-ка України. – Київ, 2016. – С.72-77.
Ясь О. Олена Апанович та Олена Компан у культурному просторі української радянської історіографії, або дві версії модернізації історичного наративу 1960-х – початку 1970-х років // Архіви України. – 2020. – № 3. – С. 32–52. https://www.academia.edu/44444246
Strategi Solo vs Squad di Free Fire: Cara Menang Mudah!