1940 року Естонія була приєднана до СРСР, і естонські спортсмени в період з 1952 по 1988 року виступали на Олімпійських іграх за команду СРСР. Після розпаду СРСР і проголошення 1991 року Естонією незалежності, на Олімпійських іграх знову почала виступати самостійна естонська команда.
За час виступу на Олімпійських іграх естонські спортсмени завоювали 46 олімпійських медалей: 13 золотих, 10 срібних і 23 бронзових. Практично всі медалі були завойовані на літніх Олімпійських іграх. Найбільше медалей естонці завоювали у змаганнях з боротьби та важкої атлетики. Серед зимових видів спорту естонці відзначалися в лижних перегонах.
