IFNGR1

IFNGR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FG9, 1FYH, 1JRH
Ідентифікатори
Символи	IFNGR1, CD119, IFNGR, IMD27A, IMD27B, interferon gamma receptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 107470 MGI: 107655 HomoloGene: 359 GeneCards: IFNGR1
Онтологія гена Молекулярна функція • interferon-gamma receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0019974 cytokine binding • GO:0016518 cytokine receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана Біологічний процес • response to virus • regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • interferon-gamma-mediated signaling pathway • cytokine-mediated signaling pathway • microglial cell activation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • astrocyte activation • negative regulation of amyloid-beta clearance • positive regulation of amyloid-beta formation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3459	15979
Ensembl	ENSG00000027697	ENSMUSG00000020009
UniProt	P15260	P15261
RefSeq (мРНК)	NM_000416 NM_001363526 NM_001363527	NM_010511
RefSeq (білок)	NP_000407 NP_001350455 NP_001350456	NP_034641
Локус (UCSC)	Хр. 6: 137.2 – 137.22 Mb	Хр. 10: 19.47 – 19.49 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IFNGR1 (англ. Interferon gamma receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 489 амінокислот, а молекулярна маса — 54 405^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALLFLLPLV		MQGVSRAEMG		TADLGPSSVP		TPTNVTIESY		NMNPIVYWEY
QIMPQVPVFT		VEVKNYGVKN		SEWIDACINI		SHHYCNISDH		VGDPSNSLWV
RVKARVGQKE		SAYAKSEEFA		VCRDGKIGPP		KLDIRKEEKQ		IMIDIFHPSV
FVNGDEQEVD		YDPETTCYIR		VYNVYVRMNG		SEIQYKILTQ		KEDDCDEIQC
QLAIPVSSLN		SQYCVSAEGV		LHVWGVTTEK		SKEVCITIFN		SSIKGSLWIP
VVAALLLFLV		LSLVFICFYI		KKINPLKEKS		IILPKSLISV		VRSATLETKP
ESKYVSLITS		YQPFSLEKEV		VCEEPLSPAT		VPGMHTEDNP		GKVEHTEELS
SITEVVTTEE		NIPDVVPGSH		LTPIERESSS		PLSSNQSEPG		SIALNSYHSR
NCSESDHSRN		GFDTDSSCLE		SHSSLSDSEF		PPNNKGEIKT		EGQELITVIK
APTSFGYDKP		HVLVDLLVDD		SGKESLIGYR		PTEDSKEFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Aguet M., Dembic Z., Merlin G. (1988). Molecular cloning and expression of the human interferon-gamma receptor. Cell. 55: 273—280. PMID 2971451 DOI:10.1016/0092-8674(88)90050-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Stueber D., Friedlein A., Fountoulakis M., Lahm H.-W., Garotta G. (1993). Alignment of disulfide bonds of the extracellular domain of the interferon gamma receptor and investigation of their role in biological activity. Biochemistry. 32: 2423—2430. PMID 8443182 DOI:10.1021/bi00060a038
• Thye T., Burchard G.D., Nilius M., Mueller-Myhsok B., Horstmann R.D. (2003). Genomewide linkage analysis identifies polymorphism in the human interferon-gamma receptor affecting Helicobacter pylori infection. Am. J. Hum. Genet. 72: 448—453. PMID 12516030 DOI:10.1086/367714

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5439 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-01 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P15260 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»