PROFILBARU.COM

HIST1H1D
Ідентифікатори
Символи	H1-3, H1.3, H1D, H1F3, H1s-2, histone cluster 1, H1d, histone cluster 1 H1 family member d, H1.3 linker histone, cluster member, HIST1H1D
Зовнішні ІД	OMIM: 142210 MGI: 107502 HomoloGene: 68456 GeneCards: H1-3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • chromatin DNA binding; • RNA binding; • double-stranded DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleosomal DNA binding;
Клітинна компонента	• Нуклеосома; • клітинне ядро; • хромосома;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • histone H3-K4 trimethylation; • nucleosome assembly; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • histone H3-K27 trimethylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • chromosome condensation; • negative regulation of DNA recombination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3007
	14957
	ENSG00000124575
	ENSMUSG00000052565
	P16402
	P43277
	NM_005320
	NM_145713
	NP_005311
	NP_663759
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HIST1H1D (англ. Histone cluster 1 H1 family member d) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 22 350^[4].

Представник родини білків гістонів H1.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSETAPLAPT	IPAPAEKTPV	KKKAKKAGAT	AGKRKASGPP	VSELITKAVA
ASKERSGVSL	AALKKALAAA	GYDVEKNNSR	IKLGLKSLVS	KGTLVQTKGT
GASGSFKLNK	KAASGEGKPK	AKKAGAAKPR	KPAGAAKKPK	KVAGAATPKK
SIKKTPKKVK	KPATAAGTKK	VAKSAKKVKT	PQPKKAAKSP	AKAKAPKPKA
AKPKSGKPKV	TKAKKAAPKK	K

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Albig W., Kardalinou E., Drabent B., Zimmer A., Doenecke D. (1991). Isolation and characterization of two human H1 histone genes within clusters of core histone genes. Genomics. 10: 940—948. PMID 1916825 DOI:10.1016/0888-7543(91)90183-F
Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ohe Y., Hayashi H., Iwai K. (1989). Human spleen histone H1. Isolation and amino acid sequences of three minor variants, H1a, H1c, and H1d. J. Biochem. 106: 844—857. PMID 2613692 DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a122941
Parseghian M.H., Henschen A.H., Krieglstein K.G., Hamkalo B.A. (1994). A proposal for a coherent mammalian histone H1 nomenclature correlated with amino acid sequences. Protein Sci. 3: 575—587. PMID 8003976 DOI:10.1002/pro.5560030406
Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts. Chromosome Res. 8: 405—424. PMID 10997781 DOI:10.1023/A:1009262819961