Згідно з турецькими офіційними дефтерами, які донині зберігаються у Стамбулі, 1477 року, через 14 років після падіння Боснії, базар (торговельний центр) Чайниче налічував 190 сімей та 5 одинаків. Назва «Чайниче» вказує на перське походження і має значення «хороша і холодна вода». Справді, Чайниче дуже багате на воду. Багато людей, відкривши це, оселялися там. Пізніше це виявляли чимало подорожніх різних років. Докладніші відомості та опис Чайнича того часу знаходиться у подорожніх записах відомого турецького мандрівного письменника Евлії Челебі, який побував у цьому містечку в 1664 році. Він описує Чайниче як «дивне місце, хвилясте і горбисте, якого ще ніде не бачив. Оточене великими пагорбами з величезними деревами та жахливими понорами, своїм положенням одночасно навіює веселість, небезпеку і страх, тоді як із другого боку справжні райські сади. Про сам «шехер» (місто) мандрівник зазначає, що в ньому 5 мусульманських і 3 християнські махали (житлові міські квартали), 700 великих і малих одноповерхових і двоповерхових будівель, укритих черепицею, дошками, ґонтом і кам'яними плитами. Водночас автор відзначає, що місто має 50 водяних млинів, три медресе, п'ять мектебів, чотири текіїдервішів, три хани, імарет (кухня для бідних), один хамам і близько 200 крамниць.
У складі Герцеговинського санджаку містечко пробуло до 1572 року. Тільки в 1582 році воно згадується як окремий кадилук.
Містечко відоме своїми майстрами обробки металів і випуском срібних монет XVIII ст. (срібні акче)[5]. Воно також багате в культурно-історичному сенсі. XV століттям датується написане на пергаментіхорватською кирилицею четверне євангеліє, яке за місцем знахідки називається Чайницьким євангелієм[6]. Османське панування тривало до 1878 року, коли містечко окупувала Австро-Угорщина.
Під час сербської агресії проти Боснії і Герцеговини містечко потрапило під окупацію військ Республіки Сербської, частиною якої є і донині. Протягом цієї війни було вигнано велику кількість несербського населення. Було зруйновано і досі не відбудовано стародавню мечеть Сінан-Беґа з 1570 року та ще чотири інші мечеті.
↑Hrvatski leksikon A-K, Naklada Leksikon d.o.o., Zagreb, 1996., str. 207.
↑Nacionalni sastav stanovništva - rezultati republike po općinama i naseljima 1991., Bilten br.234, Sarajevo 1991., Zavod za statistiku Bosne i Hercegovine, Sarajevo
↑Savezni zavod za statistiku i evidenciju FNRJ i SFRJ: Popis stanovništva 1981. [Архівовано 4 березня 2016 у Wayback Machine.], str. 77
↑Savezni zavod za statistiku i evidenciju FNRJ i SFRJ: Popis stanovništva 1971. [Архівовано 4 березня 2016 у Wayback Machine.], str. 51
↑Savezni zavod za statistiku i evidenciju FNRJ i SFRJ: Popis stanovništva 1961. [Архівовано 20 грудня 2013 у Wayback Machine.], str. 61