Почав кар'єру в чемпіонаті Франції у футбольному клубі «Мец», де за шість років забив понад 40 м'ячів, після чого переїхав у Марсель, де виступав за клуб «Олімпік». Після ЧЄ-2000 за 10 млн євро поїхав в «Арсенал» до Арсена Венгера.
Через травму пропустив ЧС-2002 в Південній Кореї/Японії, на який покладав великі надії. Учасник ЧЄ-2004. З позиції лівого інсайда міг не тільки розвивати атаки триколірних, але і забивати. У складі «Арсенала» в останні роки вважався одним з найкращих атакуючих півзахисників Європи. Віддає перевагу грі на флангах (зазвичай зліва), нерідко забиває.
У 2006 році покинув «Арсенал», перебравшись в іспанський «Вільяреал». Пірес грав у футболці «Вільяреала» до 2010 року. За час свого перебування в клубі гравець провів на полі 100 матчів, в яких забив 15 голів.