Кратер Перрайн має полігональну форму й зазнав значних руйнувань, західна частина чаші і валу перекрита сателітним кратером Перрайн S, до якого, у свою чергу, на заході прилягає сателітний кратер Перрайн T. Вал згладжений, у північній і південній своїх частинах практично зрівнявся з навколишньою місцевістю, найкраще збереглась південно-східна частина валу з достатньо чітко окресленою крайкою. Східна частина валу частково перекрита парою сателітних кратерів Перрайн E і G. Внутрішнній схил валу у східній частині зберіг залишки терасоподібної структури. Дно чаші кратера між східною частиною валу і сателітним кратером Перрайн S має форму півмісяця, є відносно рівним та відзначене лише парою маленьких кратерів.