Swarthmore Koleji'nden 1980 yılında mezun oldu. 1985'te Yale Üniversitesi'nde felsefe yüksek lisansını ve hukuk öğrenimini tamamladı. 1993'te Yale Üniversitesi'nde tarih doktorasını tamamladı. Şubat 2005'te Yazılım Özgürlüğü Hukuk Merkezi'ni kurdu. Bu merkez, Dünya çapında tüm özgür yazılım projelerine hukuki danışmanlık hizmeti vermekte ve özgür yazılımların haklarını kimi zaman dev firmalara ve hükûmetlere karşı savunmaktadır.
Özgür yazılım konusundaki tutumu
Moglen, özgür yazılımın teknolojik aygıtlara bağlı bir toplumun özgür ve demokratik olabilmesi için temel gereksinimlerden biri olduğunu söylemektedir. Ancak özgür yazılım sayesinde kontrol edilebilecek bu aygıtlar sayesinde güç eşit olarak dengelenebilir.