Hon var en del av Englands trupp under VM i Kanada år 2015. Hon fick speltid i tre av lagets matcher under turneringen där England tog brons.[4]
Den 8 juni 2018 utnämndes Stoney till huvudtränare för det nystartade seniordamlaget Manchester United.[2] I sin första säsong vann laget FA Women's Championship, vilket ledde till en uppflyttning till högsta ligan – Women's Super League, FA WSL.[5] Säsongen 2019/2020 avslutades abrupt i maj på grund av covid-19-pandemin. Manchester United slutade på en fjärdeplats.[6]
Privatliv
Den 10 februari 2014 kom Stoney ut offentligt att hon var lesbisk.[7] Hon är i ett förhållande med sin tidigare Lincoln-lagkamrat Megan Harris.[8] Den 16 juli 2014 meddelade hon att Harris var gravid med tvillingar,[9] som föddes i november 2014.[10] Stoneys tredje barn föddes i december 2017.