PAS domen

PAS savijanje
Struktura PAS domena bakterijskog senzora kiseonika fixL.[1] Protein je prikazan u trakastoj notaciji u bojama duge (N-terminus = plavo, C-terminus = crveno. Hem ligand je u sredini (ugljenik = belo, azot = plavo, kiseonik = crveno, gvožđe = naradžasto).
Identifikatori
Simbol	PAS
Pfam	PF00989
InterPro	IPR013767
SMART	PAS
PROSITE	PDOC50112
SCOP	2phy
SUPERFAMILY	2phy
Dostupne proteinske strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum structure summary

PAS domen je proteinski domen koji je sadržan u mnogim signalnim proteinima gde funkcioniše kao senzor signalna.^[2][3] PAS domeni su prisutni u velikom broju organizama od bakterija do ljudi. PAS domen je imenovan koristeći početna slova tri proteina:

• Per – Protein cirkadijanskog perioda
• Arnt – Nuklearni transporter arilnog ugljovodoničnog receptora
• Sim – SIM1

Mnogi proteini sa PAS domenom detektuju signal putem asocijacije sa kofaktorom, kao što je hem.^[4] Proteini koji sadrže PAS domen obuhvataju induktivne faktore hipoksije.

Reference

1. PDB: 1y28​; Dunham CM, Dioum EM, Tuckerman JR, Gonzalez G, Scott WG, Gilles-Gonzalez MA (2003). „A distal arginine in oxygen-sensing heme-PAS domains is essential to ligand binding, signal transduction, and structure”. Biochemistry. 42 (25): 7701—8. PMID 12820879. doi:10.1021/bi0343370. 
2. Ponting CP, Aravind L (1997). „PAS: a multi-functional domain family comes to light”. Curr. Biol. 7 (11): R674—7. PMID 9382818. doi:10.1016/S0960-9822(06)00352-6. 
3. Hefti MH, Françoijs KJ, de Vries SC, Dixon R, Vervoort J (2004). „The PAS fold. A redefinition of the PAS domain based upon structural prediction”. Eur. J. Biochem. 271 (6): 1198—208. PMID 15009198. doi:10.1111/j.1432-1033.2004.04023.x. 
4. Gilles-Gonzalez MA, Gonzalez G (2004). „Signal transduction by heme-containing PAS-domain proteins”. J. Appl. Physiol. 96 (2): 774—83. PMID 14715687. doi:10.1152/japplphysiol.00941.2003.